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文档简介

第33章蛋白质的生物合成

Chapter13

BiosynthesisofProtein蛋白质的生物合成过程,就是将DNA传递给mRNA的遗传信息,再具体的解译为蛋白质中氨基酸排列顺序的过程,这一过程被称为翻译(translation)。

第一节

参与蛋白质生物合成的物质

生物体内的各种蛋白质都是生物体内利用约20种氨基酸为原料自行合成的。参与蛋白质生物合成的各种因素构成了蛋白质合成体系,该体系包括:①

mRNA:作为蛋白质生物合成的模板,决定多肽链中氨基酸的排列顺序;②

tRNA:搬运氨基酸的工具;③

核糖体:蛋白体生物合成的场所;④

酶及其他蛋白质因子;⑤

供能物质及无机离子。

一、mRNA作为指导蛋白质生物合成的模板。mRNA中每三个相邻的核苷酸组成三联体,代表一个氨基酸的信息,此三联体就称为密码(coden)。共有64种不同的密码。原核生物的转录与翻译同步进行无义突变蛋白质的合成是N端——C端遗传密码的连续性二、tRNA

在氨基酸tRNA合成酶催化下,特定的tRNA可与相应的氨基酸结合,生成氨基酸tRNA,从而携带氨基酸参与蛋白质的生物合成。tRNA反密码环中部的三个核苷酸构成三联体,可以识别mRNA上相应的密码,此三联体就称为反密码(anticoden)。

反向互补转运RNA(tRNA)tRNA的功能tRNA分子上与蛋白质合成有关的位点:1.3′端-CCA上的氨基酸接受位点。2.识别氨酰-tRNA合成酶的位点。3.核糖体识别位点,使延长中的肽链附着于核糖体上。4.反密码子位点。第一套密码系统、第二套密码系统校正tRNA:mRNA发生突变后,tRNA的反密码子也突变搬来相近的氨基酸反密码对密码的识别,通常也是根据碱基互补原则,即A—U,G—C配对。但反密码的第一个核苷酸与第三核苷酸之间的配对,并不严格遵循碱基互补原则。如反密码第一个核苷酸为Ⅰ,则可与A、U或C配对,如为U,则可与A或G配对,这种配对称为不稳定配对。能够识别mRNA中5′端起动密码AUG的tRNA是一种特殊的tRNA,称为起动tRNA。在原核生物中,起动tRNA是一种携带甲酰蛋氨酸的tRNA,即tRNAifmet;而在真核生物中,起动tRNA是一种携带蛋氨酸的tRNA,即tRNAimet。在原核生物和真核生物中,均存在另一种携带蛋氨酸的tRNA,识别非起动部位的蛋氨酸密码,AUG。

均被同一种甲硫氨酰tRNA合成酶合成三、rRNA和核蛋白体原核生物中的核蛋白体大小为70S,可分为30S小亚基和50S大亚基。小亚基由16SrRNA和21种蛋白质构成,大亚基由5SrRNA,23SRNA和35种蛋白质构成。真核生物中的核蛋白体大小为80S,也分为40S小亚基和60S大亚基。小亚基由18SrRNA和30多种蛋白质构成,大亚基则由5SrRNA,28SrRNA和50多种蛋白质构成,在哺乳动物中还含有5.8SrRNA。

核蛋白体的组装大肠杆菌核蛋白体的空间结构为一椭圆球体,其30S亚基呈哑铃状,50S亚基带有三角,中间凹陷形成空穴,将30S小亚基抱住,两亚基的结合面为蛋白质生物合成的场所。

核蛋白体的大、小亚基分别有不同的功能:

1.小亚基:可与mRNA、GTP和起动tRNA结合。

2.大亚基:(1)具有两个不同的tRNA结合点。A位(右)——受位或氨酰基位,可与新进入的氨基酰tRNA结合;P位(左)——给位或肽酰基位,可与延伸中的肽酰基tRNA结合。(2)具有转肽酶活性:将P位上的肽酰基转移给A位上的氨基酰tRNA,形成肽键。(3)具有GTPase活性,水解GTP,获得能量。

(4)具有起动因子、延长因子及释放因子的结合部位。

在蛋白质生物合成过程中,常常由若干核蛋白体结合在同一mRNA分子上,同时进行翻译,但每两个相邻核蛋白之间存在一定的间隔,形成念球状结构。由若干核蛋白体结合在一条mRNA上同时进行多肽链的翻译所形成的念球状结构称为多核蛋白体。

四、起动因子(IF)这是一些与多肽链合成起动有关的蛋白因子。原核生物中存在3种起动因子,分别称为IF1-3。在真核生物中存在9种起动因子(eIF)。其作用主要是促进核蛋白体小亚基与起动tRNA及模板mRNA结合。

五、延长因子(EF)原核生物中存在3种延长因子(EFTU,EFTS,EFG),真核生物中存在2种(EF1,EF2)。其作用主要促使氨基酰tRNA进入核蛋白的受体,并可促进移位过程。

六、释放因子(RF)原核生物中有4种,在真核生物中只有1种。其主要作用是识别终止密码,协助多肽链的释放。

七、氨基酰tRNA合成酶该酶存在于胞液中,与特异氨基酸的活化以及氨基酰tRNA的合成有关。每种氨基酰tRNA合成酶对相应氨基酸以及携带氨基酸的数种tRNA具有高度特异性,这是保证tRNA能够携带正确的氨基酸对号入座的必要条件。目前认为,该酶对tRNA的识别,是因为在tRNA的氨基酸臂上存在特定的识别密码,即第二套遗传密码。

八、供能物质和无机离子多肽链合成时,需ATP、GTP作为供能物质,并需Mg2+、K+参与。氨基酸活化时需消耗2分子高能磷酸键,肽键形成时又消耗2分子高能磷酸键,故缩合一分子氨基酸残基需消耗4分子高能磷酸键。

第二节

蛋白质生物合成过程

蛋白质生物合成过程包括三大步骤:①氨基酸的活化与搬运;②活化氨基酸在核蛋白体上的缩合;③多肽链合成后的加工修饰。

一、氨基酸的活化与搬运

氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。其反应过程为:

可纠正错误的酰化氨基酸的活化氨基酰-tRNA

合成酶氨基酸+ATP+tRNA+H2O

氨基酰-tRNA+AMP+PPi在此反应中,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酸tRNA,从而使活化氨基酸能够被搬运至核蛋白体上参与多肽链的合成。

氨基酸tRNA的合成,可使氨基酸

①活化;②搬运;③定位。

ATP+HOOCCH(NH2)R→A—P—OCCH(NH2)R+PPiPA—P—OCCH(NH2)R+tRNA→RCH(NH2)CO-tRNA+AMPP氨基酸活化的总反应式是:氨基酰-tRNA

合成酶氨基酸+ATP+tRNA+H2O

氨基酰-tRNA+AMP+PPi每一种氨基酸至少有一种对应的氨基酰-tRNA

合成酶。它既催化氨基酸与ATP的作用,也催化氨基酰基转移到tRNA。氨基酰-tRNA

合成酶具有高度的专一性。每一种氨基酰-tRNA

合成酶只能识别一种相应的tRNA。tRNA

分子能接受相应的氨基酸,决定于它特有的碱基顺序,而这种碱基顺序能够被氨基酰-tRNA

合成酶所识别。二、活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环

活化氨基酸缩合生成多肽链的过程在核蛋白体上进行。活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA上的密码并缩合生成多肽链的循环反应过程,称为核蛋白体循环。核蛋白体循环过程可分为起动、延长和终止三个阶段,这三个阶段在原核生物和真核生物类似,现以原核生物中的过程加以介绍。

现在已经知道作为多肽合成起始信号的密码子有两个,即甲硫氨酸的密码子(AUG)和缬氨酸的密码子(GUG)(极少出现)。在大肠杆菌中,起始密码子AUG所编码的氨基酸并不是甲硫氨酸本身,而是甲酰甲硫氨酸。

(一)起动阶段:

1.30S起动复合物的形成:在起动因子的促进下,30S小亚基与mRNA的起动部位,起动tRNA(fmet-tRNAfmet),和GTP结合,形成复合体。

蛋白质合成起始复合物的形成核糖体大小亚基,起始tRNA,蛋白合成因子原核生物中的起始tRNA是fMet-tRNAfMet真核生物中的起始tRNA是Met-tRNAMet形成过程:mRNA先与核糖体的小亚基结合,起始tRNA再结合上来,再与核糖体的大亚基结合最后形成80SrRNA-mRNA-Met-tRNAMet原核mRNA的起动部位由一段富含嘌呤的特殊核苷酸顺序组成,称为SD序列(核蛋白体结合位点,RBS),可被核蛋白体小亚基16S的3,端辨认结合。真核生物中的mRNA具有帽子结构,已知需一种特殊的帽子结合蛋白(CBP)以识别此结构。

2.70S起动前复合体的形成:IF3从30S起动复合体上脱落,50S大亚基与复合体结合,形成70S起动前复合体。

3.70S起动复合体的形成:GTP被水解,IF1和IF2从复合物上脱落。此时,tRNAfmet的反密码UAC与mRNA上的起动密码AUG互补结合,tRNAfmet结合在核蛋白的给位(P位)。

延伸:大亚基上的A位与P位,A位对应密码子

第一个氨基酸结合到P位,第二个A位氨基酸之间形成肽键,肽转移酶A位空缺第三个氨基酸再结合到A位,循环延伸终止:终止密码子出现在A位时,无配对的AA-tRNA,P位的AA与tRNA的连接水解,tRNA与完整的多肽链释放肽键的形成不需要任何蛋白因子,是核糖体自身催化完成的(二)肽链延长阶段:

1.进位:与mRNA下一个密码相对应的氨基酰tRNA进入核蛋白体的A位。此步骤需GTP,Mg2+,和EF参与。

2.成肽:在转肽酶的催化下,将P位上的tRNA所携带的甲酰蛋氨酰基或肽酰基转移到受位上的氨基酰tRNA上,与其α-氨基缩合形成肽键。此步骤需Mg2+,K+。P位上已失去蛋氨酰基或肽酰基的tRNA从核蛋白上脱落。

3.移位:核蛋白体向mRNA的3'-端滑动相当于一个密码的距离,同时使肽酰基tRNA从受体移到给位。此步骤需EF(EFG)、GTP和Mg2+参与。此时,核蛋白体的A位留空,与下一个密码相对应的氨基酰tRNA即可再进入,重复以上循环过程,使多肽链不断延长。

(三)肽链终止阶段:核蛋白体沿mRNA链滑动,不断使多肽链延长,直到终止信号进入受位。

1.识别:RF识别终止密码,进入核蛋白体的受位。

2.水解:RF使转肽酶变为水解酶,多肽链与tRNA之间的酯键被水解,多肽链释放。

3.解离:通过水解GTP,使核蛋白体与mRNA分离,tRNA、RF脱落,核蛋白体解离为大、小亚基。

第一个tRNA把一个氨基酸放在肽链起始位置上;另一个tRNA带来第二个氨基酸。第一个氨基酸以羧基联到第二个氨基酸上,形成肽键。核糖体向右移三个核苷酸位置,第一个tRNA脱落,准备好位置迎接第三个tRNA及其所带的氨基酸。

合成过程连续进行

直到在mRNA上出现休止符号的密码子。于是,不再有新的tRNA上来,肽链合成结束。核糖体与mRNA脱开。三、多肽链合成后的加工修饰

(一)一级结构的加工修饰:1.N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除:N端甲酰蛋氨酸,必须在多肽链折迭成一定的空间结构之前被切除。①去甲酰化:

甲酰化酶甲酰蛋氨酸-肽甲酸+蛋氨酸-肽

②去蛋氨酰基:

蛋氨酸氨基肽酶

蛋氨酰-肽

蛋氨酸

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