分子生物学--名词解释(全).doc

1. 半保留复制（semiconservative replication）：DNA复制时，以亲代DNA的每一股做模板，以碱基互补配对原则，合成完全相同的两个双链子代DNA，每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链，这种现象称为半保留复制。 2. 复制子replicon：由一个复制起始点构成的DNA复制单位。 57. 复制起始点(Ori C)DNA在复制时，需在特定的位点起始，这是一些具有特定核苷酸序列顺序的片段，即复制起始点。 24.（35）复制叉（replication fork）是DNA复制时在DNA链上通过解旋、解链和SSB蛋白的结合等过程形成的Y字型结构称为复制叉。 3. Klenow 片段klenow fragment：DNApol I（DNA聚合酶I）被酶蛋白切开得到的大片段。 4. 外显子exon、extron：真核细胞基因DNA中的编码序列，这部分可转录为RNA，并翻译成蛋白质，也称表达序列。 5.（56） 核心启动子core promoter：指保证RNA聚合酶转录正常起始所必需的、最少的DNA序列，包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区。（Hogness区） 6. 转录（transcription）：是在 DNA的指导下的RNA聚合酶的催化下，按照硷基配对的原则，以四种核苷酸为原料合成一条与模板DNA互补的RNA 的过程。 7. 核酶（ribozyme）：是具有催化功能的RNA分子，是生物催化剂，可降解特异的mRNA序列。 8.（59）信号肽signal peptide：常指新合成多肽链中用于指导蛋白质的跨膜转移（定位）的N-末端的氨基酸序列（有时不一定在N端）。 9. 顺式作用元件（cis-acting element）：真核生物DNA中与转录调控有关的核苷酸序列，包括增强子、沉默子等。 10.错配修复（mismatch repair，MMR）：在含有错配碱基的DNA分子中，使正常核苷酸序列恢复的修复方式；主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对，还能修复一些因复制打滑而产生的小于4nt的核苷酸插入或缺失。 修复的过程是：识别出正确的链，切除掉不正确的部分，然后通过DNA聚合酶III和DNA连接酶的作用，合成正确配对的双链DNA。 直接修复direct repair：是将被损伤碱基恢复到正常状态的修复。有三种修复方式：1光复活修复2、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶修复3单链断裂修复。切除修复 (excission repairing):也称核苷酸外切修复，这是一种取代紫外线等辐射物质所造成的损伤部位的暗修复系统。对多种DNA损伤包括碱基脱落形成的无碱基点、嘧啶二聚体、碱基烷基化、单链断裂等都能起修复作用。此系统是在几种酶的协同作用下，先在损伤的任一端打开磷酸二酯键，然后外切掉一段寡核苷酸；留下的缺口由修复性合成来填补，再由连接酶将其连接起来。不同的DNA损伤需要不同的特殊核酸内切酶来识别和切割。主要包括碱基切除修复和核苷酸切除修复两类 29.碱基切除修复（base excision repair）：由DNA糖基化酶始发先识别受损碱基，通过DNA链的局部扭曲而使受损碱基突出，之后水解受损碱基与脱氧核糖之间的糖苷键，除去受损碱基，产生无嘌呤或无嘧啶位点，即AP位点。AP内切核酸酶能识别AP位点，在该位点的5侧端将DNA链切断。 37.核苷酸切除修复（nucleotide excision repairNER）当DNA结构有较大损伤变形（包括胸腺嘧啶二聚体在内）或DNA链多处发生严重损伤时，将诱导短或长片段的修复。以NER的方式修复，无须DNA糖基化酶协助。在NER修复系统中，已损伤的片段由切除酶识别并切除，该酶是一种内切核酸酶，但它是在链损伤部位的两侧同时切开（有别于一般的内切核酸酶），切除包括含损伤区域在内的一段寡核苷酸链。 41. 重组修复(recombination repairing)：双链DNA中的一条链发生损伤，在DNA进行复制时，由于该损伤部位不能成为模板，不能合成互补的DNA链，所以产生缺口，而从原来DNA的对应部位切出相应的部分将缺口填满，从而产生完整无损的子代DNA的这种修复现象。重组修复的主要步骤有：1复制2重组3再合成 36.SOS修复：易错修复、SOS反应应急（SOS response）许多造成DNA损伤或抑制DNA复制的过程能引起一系列复杂的诱导效应，称为应急反应。（SOS系统只在细胞受到严重损伤或复制系统受到抑制时才出现， 系统是在DNA分子受到大范围的损伤情况下防止细胞死亡而诱导出的一种应急措施，是使细胞通过一定水平的变异来换取最后幸存手段。）11. 半不连续复制（semi-discontinuous replication）是指DNA复制时，前导链上DNA的合成是连续的，后随链上是不连续的，故称为半不连续复制。半不连续复制在DNA复制过程中，亲代DNA分子中以3-5方向的母链作为模板指导新的链以5-3 方向连续合成; 另一股以5-3 为方向的母链则指导新合成的链以 5-3方向合成10002000个核苷酸长度的许多不连续的片段（岗崎片段），这种复制方式称之为半不连续复制。 12.岗崎片段（Okazaki fragment）：DNA复制时，一股以5-3方向的母链作为模板，指导新合成的链沿5-3合成10002000个核苷酸不连续的小片段称之为岗崎片段。 46. 前导链（leading strand）：DNA复制时，一股以3-5方向的母链作为模板，指导新合成的链以5-3方向连续合成的链称为前导链。（复制方向与解链方向一致） 40.后随链、 随从链（lagging strand): DNA复制时，一股以5-3方向的母链作为模板，指导新合成的链沿5-3合成，10002000个核苷酸不连续的小片段的链称为随从链。（复制方向与解链方向相反) 13. 内含子（intron）：真核细胞基因DNA中的不编码序列，这部分序列并不编码蛋白质，又称间隔序列或插入序列。 外显子（exon or extron）：真核细胞基因DNA中的编码序列，这部分序列可转录为RNA，并翻译成蛋白质，也称表达序列。 14. 基因突变（genetic mutation）由于DNA分子中发生碱基对的增添、缺失或改变，而引起的基因结构的改变，就叫做基因突变。 15.转座子（transposon, Tn）：转座子也叫做转座元件、跳跃基因。是在基因组中可移动的DNA序列，不以独立的形式存在（如质粒或噬菌体DNA等），而在基因组内由一个部位直接转移到另一个部位。 60. 转座：一个转座子由一个部位转移到另一个部位的过程称为转座。转座发生的频率很低，而且插入位点是随机的，不依赖转座子与靶位点之间的任何同源性。 16.启动子（promoter)是指RNA聚合酶识别，结合并开始转录的一段DNA序列。它包括4个区域：转录的起始点，-10区（pribnow box，富含AT，其一致序列为TATAAT），-35区 一致序列为TTGACA，-10与-35之间的序列。 17. 密码的简并性（degeneracy）：同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象称为密码子的简并性。 18. SD序列 SD sequence：mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。SD序列在细菌mRNA起始密码子AUG上游10个碱基左右处，有一段富含嘌呤的碱基序列，能与细菌16SrRNA3端识别，帮助从起始AUG处开始翻译。 19. 反式作用因子（trans-acting factor）： 反式作用因子又称转录因子(transcriptionfactors，TF)。绝大多数真核转录调节因子由某一基因表达后，通过与特异的顺式作用元件相互作用反式激活另一基因的转录，故称反式作用因子。（是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质。） 20. 操纵子（operon）：原核生物中几个功能相关的结构基因成簇串联排列组成的一个基因表达的协同单位（DNA序列） 21.遗传密码子的简并性（degeneracy），遗传密码的简并性是指编码同一氨基酸的几个三联体遗传密码中，一、二位碱基大多是相同的，只是第三位不同。22. 增强子(enhancer)指增加同它连锁的基因转录频率的DNA序列。 沉默子(silencer)是参与基因表达负调控的一种元件。能够同反式因子结合从而阻断增强子及反式激活因子的作用，并最终抑制该基因的转录活性。 23.TATA 框（TATA box / Hogness box）、TATA区：酶的紧密结合位点（富含AT碱基，利于双链打开）是构成真核生物启动子的元件之一。 31.癌基因cancer gene：指人类或其他动物细胞（以及致癌病毒）固有的一类基因。又称转化基因，它们一旦活化便能促使人或动物的正常细胞发生癌变。 25.原癌基因（proto-oncogene）是细胞内与细胞增殖相关的基因，是维持机体正常生命活动所必须的，在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异，基因产物增多或活性增强时，使细胞过度增殖，从而形成肿瘤。 27.因子 （ factor）：依赖于DNA的RNA聚合酶的一个亚基。 34.转录的弱终止子：依赖于Rho蛋白糖助因子才能实现终止作用，这类终止子属于弱终止子。蛋白质辅助因子称为释放因子，通常称为因子。因子：是基因编码的蛋白质，是一种酶，它具有ATPase的活性和解链酶的活性，在水解ATP的情况下，它沿着53方向转录物的3端前进，直到遇到暂停在终止点位置的RNA聚合酶。 28.转录的强终止子（transcription terminator）：强终止子又称内部终止子（intrinsic terminators指不依赖于Rho蛋白质辅助因子（因子）而能实现终止作用，这类终止子属于强终止子，是转录（Transcription）过程中起作用的一种结构。由于其DNA模板上富含GC而使转录出的RNA上富含C和G,于是RNA与模板之间可以形成较强的氢键,成为DNARNA杂合分子,从而阻碍DNA聚合酶的前进而有利于终止。 30.锌指结构：多见于 TFIII A 和类固醇激素受体中，由一段富含半胱氨酸的多肽链构成。每四个半光氨酸残基或组氨酸残基螯合一分子 Zn2+ ，其余约 12-13 个残基则呈指样突出，刚好能嵌入 DNA 双螺旋的大沟中而与之相结合。 42.亮氨酸拉链结构：多见于真核生物 DNA 结合蛋白的 C 端，与癌基因表达调控有关。由两段 - 螺旋平行排列构成，其 - 螺旋中存在每隔 7 个残基规律性排列的亮氨酸残基，亮氨酸侧链交替排列而呈拉链状，两条肽链呈钳状与 DNA 相结合。 26.单顺反子mRNA：一个mRNA仅包含一种蛋白质的编码信息，即只含有一个开放可读框（ORF），这种mRNA称为单顺反子mRNA；真核生物mRNA通常是这种情况。 开放阅读框open reading frame，ORF 是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。 32.多顺反子mRNA：一个mRNA包含多个蛋白质的编码信息，即包含多个个开放可读框（ORF），这种mRNA称为多顺反子mRNA；这些蛋白质通常具有同一种相关的功能，并且成组的被一个操纵子（operon）所调控；原核生物mRNA通常是这种情况。 33.内部启动子internal promoter：在由RNA 聚合酶转录的5S RNA基因中，其启动子位于转录单位之内，在转录起点的下游50个碱基以后，约在+55到+80之间，故称下游启动子或内部启动子。 38.转录激活结构域transcription activating domain：转录因子中能激活基因转录的功能结构域。 39.端粒（telomere）是真核线状染色体两臂末端由特定的DNA重复序列构成的结构，使正常染色体端部间不发生融合，保证每条染色体的完整性。 45.端粒酶（telomerase）催化端粒合成的酶称为端粒酶，是由一条RNA和多种蛋白质构成的核糖核蛋白复合体（是一种特殊的DNA聚合酶，具有逆转录酶活性） 44.转录因子(transcription factor ，TF): 是真核细胞中一群能与基因5端上有特定序列专一性结合，从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。 47. 衰减子(弱化子)衰减子 （attenuator）-DNA位于L基因中,离E基因5端约30-60bp在RNA合成终止时，起终止转录信号作用的那段DNA序列。 49. PCR(Polymerase Chain Reaction) 聚合酶链式反应：是一种在体外快速扩增特定基因或DNA序列的方法。 50. 转座子（transposon, Tn）：转座子也叫做转座元件、跳跃基因。是在基因组中可移动的DNA序列，不以独立的形式存在（如质粒或噬菌体DNA等），而在基因组内由一个部位直接转移到另一个部位。 51.直接修复direct repair：是将被损伤碱基恢复到正常状态的修复。有三种修复方式：1光复活修复2、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶修复3单链断裂修复。 52.核不均一RNA：mRNA前体蛋白质编码基因的初始转录产物，统称为核不均一RNA（heterogeneous nuclear RNA, hnRNA). 53.核酶（ribozyme）是具有催化功能的RNA分子，是生物催化剂，可降解特异的mRNA序列。 43. RNA剪接（RNA splicing）：从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子，并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。 54. RNA编辑(RNA editing)是指在mRNA水平上改变遗传信息的过程。具体说来，指基因转录产生的mRNA分子中，由于核苷酸的缺失，插入或置换，基因转录物的序列不与基因编码序列互补，使翻译生成的蛋白质的氨基酸组成，不同于基因序列中的编码信息现象。 58. RNA加工（RNA processing）将一个RNA原初转录产物转换成成熟RNA分子的反应过程，加工包括从原初产物中删除一些核苷酸，添加一些基因没有编码的核苷酸和对那些碱基进行共价修饰。 48. 翻译-转运同步机制：共翻译转运，膜结合核糖体上合成的蛋白质, 在它们进行翻译的同时就开始了转运,主要是通过定位信号,一边翻译,一边进入内质网, 然后再进行进一步的加工和转移。由于这种转运定位是在蛋白质翻译的同时进行的,故称为共翻译转运。 55. 翻译后转运机制(post-translational translocation)游离核糖体上合成的蛋白质必须等蛋白质完全合成并释放到胞质溶胶后才能被转运一种机制。 61.拓扑异构酶（topoisomerase）是指可改变DNA分子的链接数，通过瞬时断开和再连接DNA分子的一条