(2021年整理)NCBI上下载基因序列

1、一.（完整版）NCBI上下载基因序列三、五、六、七、八、九、!1!、编辑整理:尊敬的读者朋友们：五、六、七、八、九、!1!、编辑整理:尊敬的读者朋友们：十、这里是精品文档编辑中心，本文档内容是由掰口我的同事精心编辑整理后发布的，发布之前我们对文中内容进行仔细校对，但是难免会有疏漏的地方，但是任然希望（完整版）NCBI上下载基因序列）的内容能够给您的工作和学习带来便利。同时也真诚的希望收到您的建议和反馈，这将是我们进步的源泉，前进的动力。十、十一、本文可编辑可修改，如果觉得对您有帮助请收藏以便随时查阅，最后祝您生活愉快业绩进步，以下为（完整版）NCBI上下载基因序列的全部内容。十二、十三、（完整

2、版）NCBI上下载基因序列十四.卜五、十六、编辑整理:张嬉雒老师十七、十八、十三、（完整版）NCBI上下载基因序列十四.卜五、十六、编辑整理:张嬉雒老师十七、十八、十九、二十、尊敬的读者朋友们:二十二、这里是精品文档编辑中心，本文档内容是由我和我的同事精心编辑整理后发二十二、布到文库，发布之前我们对文中内容进行仔细校对，但是难免会有疏漏的地方，但是我们任然希望（完整版）NCBI上下载基因序列这篇文档能够给您的工作和学习带来便利。同时我们也真诚的希望收到您的建议和反馈到下面的留言区，这将是我们进步的源泉，前进的动力。二十三、本文可编辑可修改,如果觉得对您有帮助请下载收藏以便随时查阅，最后祝您生活

3、愉快业绩进步，以下为（完整版）NCBI上下载基因序列这篇文档的全部内容.二十四、（完整版）（完整版）NC8I上下载基因序列二十五、NCBI上下载基因序列、mRNA、CDS序列的方法.打开NCBI网站，第一个框选择Gene,第二个框输入基因名称，如ALK基因，点击Search.进入第二页面后，会看到如下一系列跟ALK基因相关的信息,根据description和location的信息，找到自己需要的基因。空色框中表示的是物种.我需要的是人类的基因，故选择第一个。点击ALK,进入下一个页面.SearchresultsItems:1to20of2651FirstPimPageTJof133NextLa

4、siOSeeals073discontinuedorreplaceditems.Name/GeneIDDescnptonLocationAliasesMIMALKanaplasticlymphomareceptortyrosineChromosome2.NC000002.12CD246,NBLST3105590ID：238kinase|hfomooap/ejs(human)(ptement)AikanaplasticlymphomakinaseMusChromosome17.NC_000083.6CD246,TerrID：11682musculus(housemouse)(71868988.7

5、2604648,comptemont)AikAnaplasticlymphomakmasoChromosome2R.NT_033778.4DmGl_CG8250.ALK,CG82S0,DAlk,ID.53425Clrosop所后melanogasief(fruitfly)(1662529316640311,comptement)DAIk53,DmenCG8250.alk.dALK.mili.进入后，会看到以下关于ALK基因的详细信息:Sendto:Sendto:ALKanaplasticlymphomareceptortyrosinekinaseHomosapiens(human)GeneID

6、238,upcbledon6-D9C-2016SummaryOfficialSymbolOfficialFullNamePrimarysourceOfficialSymbolOfficialFullNamePrimarysourceSeerelatedGenetypeRefSeqstatusOrganismLirwageAlsoknownasSummaryanaplasticlymphomareceplort/rosinekinaaepro汉d5hgncHGNC.HGNCd27EnsemblENSGOOOOOI71094NN1055知VeqaOTTHUMG000G01520S4proteinc

7、odingREVIEWEDHomosapiensEukaryota.Metazoa.Chordata.Craniala.Vertebrata.Euteteostcnii.Mammaba.Eutheria.Euarchontoglres.Pnmates;Hapicrrhini.Catarrhni.Hcmmidae.Hcnx?CD246,NBLST3ThisgeneencodesarecepcortyrosinekinasewtiichbelongstotheinsulinreceptorsuperfamiyThisproteincomposesanextracellulardomain,anhy

8、drophobicstretchcorresponding10asinglepassUansmerrbraneregionandanintraceflulafkinasedomainItpteysanimportantroleinthedevelcpmentofthebrainandexertsitseffectsucoriRrnaiirnncinIhoncvraccsiciomTKccocohachoonfrwmdInhoroarranncHmiHaFcdnrnEcIrfiaHinaccriocrrfttimruircirvliidirvnsnanlachrlarnorol这些信息可以略过，

9、往下查看，点击下图红色框中的SeeALKinGenomeDataViewer,进入下个页面。GenomiccontextLocation:2P232-p231GenomiccontextLocation:2P232-p231Exoncount:2gSeeALKmGenorpePalaViewMap62回AnnotatesrefeaseStatusAssemblyChrLocationIDScurrentGRCh殁p7(GCF00000140533)2NC_CO0OO212P9192774.29921611.cogetnenl)1D5prevxiusassemblyGRCh37p13(GCF其e

10、)4L*Mtfcrt2Go，箕!_“5cqeLoreftrNe_OM09.19.3QMJ3CM(*7e)4HCMCO32C;SW2774351811x三产Jg”P92WK叩如，p?35K|S9.-CK|294I：|25eK1295MI129.WI：B|2?nKIZ94KKTook，：。Trwcia书Evaw?cokLZ9,raK-Gen”,NZS：K=rcaapianaAnnctacicnPXaaaaICS,2flie-O-0*TJlect-aaw*/tochange*w*/tochange*IO0OOfmVHWYOHTTl“DRSrDds-uRQMHTHTBn口flasg-HscoIrpnn

11、D-9AM-e3mn:!99ns4ansQBR-1SHS3S3-mmmDg郸A9jynmH-H-t-l如I，X5衿犯2Hl:；)4m，,:，H-H郴，)4m，,:，H-H郴，LM，-1-:一HTHH+T-T-阐TLCCKH9W93E6239932111一1JII;1雄，399句.2.392.21XRJ39924.2)NO3S23.2|4*1跖上7间乙河H7RW93.2MX5灰B.2HI-IP4II;1;I;:III1111IPALKGene:ALKTitle:enaplsticlyniplKnwreceptortyrosinskineloomon:ccmpi5Cnt(a132,774.2932

12、1,611)Length:726,838Mergedfeturrs:NP_004295J6dNM_0M3O4.4t，t1FM7SL51SPIDownload:NF052932NMOCHXH.WLink*ftTook|ViewCCDS:CCD533172CviewGeneiu2%alk)ViewHGNC:122ViewMIM:10558BLASTGenomk:MC8co32”口9.192力4.29.92LSI。FASfAView:NCODHfXJZcompleterecord）fiIeformat（看寿几种格式）CreateFile。常用的是FASTA格式和GenBank格式。GenBank格式

13、保存的信息更全面。GenBankw-Homosapienschromosome2,GRCh38.p7PrimaryAssemblyncbiReferencesequence-NC_000002.12FASTAG。kxQLCCUSNC_OODOD2728S38hpDNAlinearCON06-JUN-2016ZEKINITIOKHerosapienscnromoacxe2,GBChsa.p7PrixaxyAssertoly.ACCESSiciaNC00D0D2REGION：2915277.Z99Z111GPC000031294VERSIONNCOODODZ.1Z二BUNKm二CP工。J2CC：P

14、RC1l162A33e-ly：GCF800014G5.33KEYWORDSRerseq.5CURCZHerosapiens(nuzian)ORGANISMHerosapiensEujcaiyoca;Metazoa;Chordaea;Cranlaza;Vezeirata;Euteleoscord.;1CompleteRecordce(abbri1。磔IOCodngSequencesOGeneFeaiuresChoo。,DeclinationIFileOCIipboardOCollectionsOAnalysisToolDownload1demsFormalew|Gen6ank_vShowGl口C

15、reateFileresandCCncSend.八jshown至此就把ALK基因的序列下载了。二.几种代号的意思水：_标记席歹恻竭至白产物。完整茁基国分子序列，标记的类别包法基班色体、细麒、质粒。、染水：_标记席歹恻竭至白产物。完整茁基国分子序列，标记的类别包法基班色体、细麒、质粒。、染杉:故闻邳晅我，住俄NCB】至地主辉连径”匕女代表性前车初圆县因或者那些很泄自行化注ACCESSION是NCBI序列数据中我们常用到编号（另一个是Gl）.ACCESSION形式为C,其中CC为两个字母，其不同组合又可以区分为蛋白序列、核酸序列或其因组序列,而#为位数不等的故字；ACCESSION后面又会加版本号

16、，以形式表示母后的尾数递增表示醐信息较之前的版本有所修改.这样ACCESSION+版本号就是一个唯一的袤示，代表一个唯一的序列.而且这个嫡号不会改变。ACCESSIONMOLECULEMETHODNOILAC_123456GenomicAC_123456GenomicMix”AP_123d56ProteinMixedNC_.123456GenomicMixedNG.123456GenomicMixedNM._123456mRNAMixedNM.123456789毒和原核生物。转录江切席1；成熟mRKA录聿曲卜|微信号：H引1/U修一股来说，mRNAK基因组序列是我们主要的寻找对袤。如果想找标准序列的话，mRN阳采用NM_开头的,基因组用NC_或者ACJF头的，soeasy!NP_123456NP.123456789ProteinMixedHEE；主建是全区转录覆月管序冽，但也有T总有诩：EB陆的渤5U3敌脚1。NR_1234S6RNAMixed非用足B1荏录子序列，包延结构RNAs