(病原生物学专业论文)肺炎支原体多抗原表位表达载体的构建与鉴定.pdf_第1页
(病原生物学专业论文)肺炎支原体多抗原表位表达载体的构建与鉴定.pdf_第2页
(病原生物学专业论文)肺炎支原体多抗原表位表达载体的构建与鉴定.pdf_第3页
(病原生物学专业论文)肺炎支原体多抗原表位表达载体的构建与鉴定.pdf_第4页
(病原生物学专业论文)肺炎支原体多抗原表位表达载体的构建与鉴定.pdf_第5页
已阅读5页,还剩36页未读 继续免费阅读

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

目录 一、摘要 中文论著摘要1 英文论著摘要4 二、英文缩略语7 三、论文 前言,8 刚舌” 材料与方法9 实验结果1 6 讨论2 3 结论2 5 四、本研究创新性的自我评价2 6 五、参考文献2 7 六、附录 综述2 8 在学期间科研成绩3 8 致谢3 9 个人简介4 0 中文论著摘要 肺炎支原体多抗原表位表达载体的构建与鉴定 刖再 i i , g :支原体( m y c o p l a s m ap n e u m o n i a e ,m p ) 是人类原发性非典型肺炎的病原体, 无细胞壁,其引起感染的治疗与其它细菌和病毒感染有所不同,因此,m p 感染诊 断意义重大。m p 细胞表面的粘附蛋白( 如p 1 ,p 1 1 6 等) 能与宿主细胞受体结合, 为m p 致病的重要因素,也是引起机体免疫反应的主要免疫原,应用重组蛋白抗原 检测临床标本,有较高的特异性和敏感性。国内外已有人成功构建了m pp 1 蛋白 的表达载体。为了增加重组蛋白的抗原表位,提高诊断的敏感性,本研究经p c r 点突变技( t g a - - - ,t g g ) 获取m p1 1 6 蛋白目的基因,构建克隆载体,并与原实验室 构建的p g e x 6 p 1 p 1 表达载体重组,构建肺炎支原体多抗原表位表达载体,从 克隆株中提取纯化重组蛋白,经w e s t e r nb l o t t i n g 鉴定融合蛋白的免疫反应性,为 研制更有效的肺炎支原体基因工程诊断试剂奠定基础。 方法 1 、m pd n a 的制备 按本实验室常规方法进行。 2 、p c r 点突变扩增m p1 1 6 目的基因 根据g e n b a n k 提供的m p1 1 6 蛋白基因( 2 4 6 卜3 0 5 1 ) 序列,通过引物分析软 件p r i m e r 5 0 和o l i g 0 6 设计引物,上游引物序列:5 - t t t t g g a t c c t t c a a a g 触隗a c 朋r c c a a g t g 3 ( b a m l ) ,下游引物序列:5 a t a t g a 筒盯c t t t g a a g c c c a t g t c a g t a a a g 3 ( e c o r i ) ,突变引物片:列:5 g a c c t t t g g t t g t r l a a g a ”陌g g c c w 姨g t t c 3 。p c r 扩增突变片段,加2 0 9 m 的突变引物和下游引物以 及1 0 0 n g 模板,反应总体积5 0 9 l ,9 5 。c5 m i n x l ;9 5 c3 0 s ,5 5 c3 0 s ,7 2 。c4 0 s x 3 0 : 7 2 c l o m i n x l 。回收突变片段,以此做引物扩增目的基因,加入2 0 9 m 上游引物 和1 0 0 n g 模板,9 5 。c5 m i n x l ;9 5 cl m i n ,6 5 。cl m i n ,7 2 0 cl m i n x 3 2 ;7 2 c1 0 m i n x l 。 1 0 琼脂糖凝胶电泳鉴定。 3 、m p 克隆载体p m d t - 1 1 6 的构建与鉴定 将回收的目的基因和p m d t 载体连接,转入e e o l ij m l0 9 。通过氨苄青霉素 平板筛选阳性克隆株。质粒提取试剂盒抽提阳性克隆株的重组质粒,p c r 扩增及 酶切后电泳鉴定。插入的基因序列由南京金思特科技公司测定,并与g e n b a n k 提 供的f h 株肺炎支原体p 1 1 6 核苷酸序列进行同源性比较。 4 、m p 多抗原表位表达载体p 1 p 1 1 6 的构建与鉴定 从克隆株中提取纯化重组质粒,b a m h i 、e c o r i 双酶切后进行琼脂糖凝胶电 泳,回收目的片段,与b a m h i 、e c o r i 双酶切的p g e x 6 p 1 p 1 表达载体( p 1 表 达载体为e c o r i 、x h o i 双酶切构建) 连接,转入e c o l ij m l 0 9 。氨苄青霉素平板 筛选转化子,提取纯化重组质粒,质粒酶切图谱和p c r 扩增鉴定。 5 、重组蛋白基因表达的检测与鉴定 重组质粒p 1 p 1 1 6 转入e c o l ib l 2 1 中,将阳性克隆株培养菌液接种于含氨苄 青霉素( 1 0 0 9 9 m 1 ) 的l b 液体培养基中,3 7 。c 振荡培养过夜。离心收集菌体沉淀, 转接至2 0 0 m l a m p l b 中,3 7 。c 振荡培养3 0r a i n ,加入i p t g 至终浓度0 5 m m o l l , 诱导表达2 h 。离心收集菌体沉淀。冰裕超声破碎,离心后取上清用g l u t a t h i o n e s e p h a r o s e4 b 纯化g s t - p 1 p 11 6 融合蛋白。s d s p a g e 分析表达产物的相对分子 量,免疫印迹实验鉴定其免疫反应性。一抗为兔抗m p 全茵抗体,二抗为羊抗兔 i g g h r p 。 结果 1 、p l l 6 目的基因片段的扩增与鉴定 p c r 扩增的突变引物片段为1 7 6 b p ,扩增的目的基因片段为5 9 7 b p ,经1 o 琼脂糖凝胶电泳鉴定,扩增产物与理论值大小基本相符。 2 、p m d t - 11 6 重组质粒鉴定 以p m d i - 1 1 6 为模板,p c r 扩增出单一条带,长度与预期一致,p m d 1 - 1 1 6 用b a m h i 、e e o r i 双酶切,产生2 7 k b 和0 6 k b 两个片段。插入基因片段与已知的 p 1 1 6 核苷酸序列进行比较,除突变碱基外,其余完全一致。 2 3 、m p 表达载体的构建与鉴定 以重组质粒为模板,p c r 扩增出单一条带,长度与预期一致。重组质粒用 b a m h i 、e c o r i 双酶切产生0 6 k b 和5 8 k b 两个片段,用e c o r i 、x h o i 双酶切产生 0 9 k b 和5 5 k b 两个片段,用b a m h i 、x h o i 双酶切产生1 5 k b 和4 9 k b 两个片段。 4 、重组蛋白抗原性检测 经诱导后表达相对分子质量( m r ) 为8 1k d a 的融合蛋白,与预期的m r 大小一 致。w e s t e r nb l o t t i n g 结果显示,兔多价抗血清与纯化的融合蛋白在8 1 k d a 处形成 了一条特异的抗原一抗体反应条带。 结论 1 、本实验经p c r 点突变( t g a t g g ) 获取m p1 1 6 蛋白目的基因片段。 2 、构建了p 1 p 1 1 6 双蛋白多抗原表位的表达载体,转入大肠杆菌内,可稳定 地表达融合蛋白。 3 、w e s t e r nb l o t t i n g 证明表达的8 1 k d a 的融合蛋白具有免疫反应性。 关键词 肺炎支原体;蛋白抗原;基因克隆;p 1 1 6 3 英文论著摘要 t h ec o n s t r u c t i o na n di d e n t i f i c a t i o no f m u l t i e p i t o p e e x p r e s s i o nv e c t o ro fm y c o p l a s m ap n e u m o n i a e - i n t r o d u t i o n m y c o p l a s m ap n e u m o n i a e ( m p ) i s t h ep a t h o g e no fh u m a np r i m a r y a t y p i c a l p n e u m o n i a i t st h e r a p yi sd i f f e r e n tf r o mo t h e rb a c t e r i u ma n dv i r u sb e c a u s ei th a s n tc e l l w a l l t h e r e f o r e ,i ti sv e r yi m p o r t a n ta b o u tt h ed i a g n o s eo fm r t h ea t t a c h m e n tp r o t e i n s o nt h es u r f a c eo fm p ( e g p1 、pll6 ) c a nc o m b i n ew i t ha c c e p t o ro fh o s tc e l ls ot 1 1 e ya r e i m p o r t a n tf a c t o ro fp a t h o p o i e s i sa n dm a j o ri m m u n o g e n i th a sh i g h e rs p e c i f i c i t ya n d s e n s i b i l i t yt h a tu s i n gr e c o m b i n a t i o np r o t e i nt od e t e c tc l i n i c a ls a m p l e s t h ee x p r e s s i o n v e c t o r so fm pp1p r o t e i nw e r ec o n s t r u c t e d f o rr a i s i n ge p i t o p e so ft h er e c o m b i n a t i o n p r o t e i na n d t h es e n s i b i l i t yo ft h ed i a g n o s eo fm p , i nt h i sr e p o r tw et a k ed e s t i n a t i o ng e n e o fm p116p r o t e i nw i t h g e n em u t a t i o no fp c rt o c o n s t r u c tc l o n i n gv e c t o r , a n d r e c o m b i n a t ei tw i t he x p r e s s i o nv e c t o rp g e x - 6 p 一1 一p1w i t c hw a sc o n s t r u c t e db yf a c i l i t y t oc o n s t r u c tm p m u l t i - e p i t o p ee x p r e s s i o nv e c t o r t h er e c o m b i n a t i o np r o t e i ni se x t r a c t e d a n dp u r i f i e da n di d e n t i f i e db yw e s t e r nb l o t t i n g i tc o u l de s t a b l i s hb a s i so fm p d i a g n o s i s r e a g e n t m e t h o d s 1 p r e p a r a t i o no fa m p l i f i c a t i o nt e m p l a t e i ta c c o r dt ot h em e t h o dd e s c r i b ep r e v i o u s l yb yu s 2 a m p l i f i c a t i o no fd e s t i n a t i o ng e n eo f 咿1 16p r o t e i nw i t hg e n e m u t a t i o no fp c r 1 1 1 ep r i m e r sa r ed e s i g n e db yp r i m e r 5 0a n do l i g 0 6a c c o r d i n gt o116g e n e s e q u e n c e s ( 2 4 6 7 3 0 51 ) i ng e n b a n k p r i m e ro fu p s t r e a m :5 - t t t t g g a t c c t t c a a ag a t a a c a t c c a a g t g - 3 ( b a m i ) p r i m e ro fd o w n s t r e a m :5 - a r a t g a a t t c t t t g a a g c c c a t g t c a g t aa a g 一3 ( e c o r i ) p r i m e ro fm u t a t i o n :5 - g a c c t t t g g t t g t t t a a g a r t t g g c c t a a g t t c - 3 m u t a t i o nf r a g m e n t sp c rw a sp e r f o r m e di na5 0 9 l r e a c t i o nm i x t u r ec o n t a i n i n g2 0 9 m p r i m e ra n dlo o n gd n at e m p l a t e p c ra m p l i f i c a t i o n 4 w a sd o n eu n d e rt h ef o l l o w i n gc o n d i t i o n s :d e n a t u r a t i o na t9 5 c5 m i n xl ,9 5 c3 0 s ,5 5 。c 3 0 s ,7 2 4 0 s x 3 0 ,7 2 lo m i n x 1 m u t a t i o nf r a g m e n tw a sr e c l a i m e da so t h e rp r e m e r d e s t i n a t i o ng e n e sp c rw a sp e r f o r m e di na5 0 9 lr e a c t i o nm i x t u r ec o n t a i n i n g2 0 p m p r i m e ra n d10 0 n gd n at e m p l a t e p c ra m p l i f i c a t i o nw a sd o n eu n d e rt h ef o l l o w i n g c o n d i t i o n s :d e n a t u r a t i o na t9 5 5 m i n x l ,9 5 l m i n ,6 5 l m i n , 7 2 l m i n x 3 2 ,7 2 lo m i n x1 t h ea m p l i c o nw a si d e n t i f i e db y1 o a g a r o s eg e l 3 c o n s t r u c t i o na n di d e n t i f i c a t i o no fm pc l o n i n gv e c t o rp m d t 1 16 d e s t i n a t i o ng e n ew a sc o n n e c t e d 、历mp m d tv e c t o ra n dt r a n s f o r mt oe c o l i j m10 9 t h e nm a s c u l i n ec l o n ew a sa s s a y e do nl u r i a b e r t a n i p l a t e sc o n t a i n i n g a m p i c i l l i na n de x t r a c t e db yk i t ,c o n f i r m e db yp c ra m p l i f i c a t i o na n dr e s t r i c t i o ne n z y m e a n a l y s i s j i ns it ec o m p a n yd e t e r m i n e dn u c l e o t i d es e q u e n c eo fr e c o m b i n a n t p l a s m i d i tc o m p a r e dh o m o l o g yw i 廿l p116 g e n eo fm pf hs t r a i na c c o r d i n g t o g e n b a n k 4 c o n s t r u c t i o no f 口m u l t i - e p i t o p ee x p r e s s i o nv e c t o rp1 一p1 16 e x t r a c t i n ga n dp u r i f y i n g r e c o m b i n a n t p l a s m i d r e c o m b i n a n tp l a s m i da n d e x p r e s s i o nv e c t o rp g e x - 6 p 一1 - p1 ( e c o r l 、x h o i ) w e r ed i g e s e db yb a m h 1 、e c o r la n d c a r r yo u ta g a r o s eg e le l e c t r o p h o r e s i st or e c l a i md e s t i n a t i o nf r a g m e n t s t h e yc o n n e c t e d t o g e t h e ra n dt r a n s f o r mt oe c o l ij m 10 9 m a s c u l i n ec l o n ew a sa s s a y e do nl u r i a - b e r t a n i p l a t e sc o n t a i n i n ga m p i c i l l i n a n de x t r a c t e da n dp u r i f i e d ,c o n f i r m e db yp c r a m p l i f i c a t i o na n dr e s t r i c t i o ne n z y m ea n a l y s i s 5 d e t e c t i o na n di d e n t i f i c a t i o no fr e c o m b i n a t i o np r o t e i n e x p r e s s i o nv e c t o rp 1 - p116w a st r a n s f o r m e dt oe c o l ib l 21 b a c t e r i af l u i do f m a s c u l i n ec l o n ew a sc u l t i v a t e di nl bm e d i u mc o n t a i n i n ga m p i c i l l i n ( 10 0 9 # m 1 ) u n d e r 3 7 o v e r n i g h t b a c t e r i ap r e c i p i t a t i o nw a sc o l l e c t e db yc e n t r i f u g ea n dt r a n s f o r mt o 2 0 0 m la m pl bt oc u l t i v a t eu n d e r37 。ci n3 0 m i n t h e na d d i n gi f t gt o0 5 m m o l l , i n d u c t i n g2 h b a c t e r i ap r e c i p i t a t i o n w a sc o l l e c t e db yc e n t r i f u g ea n db r e a k e db y s u p e r s o u n di ni c e f u s i o np r o t e i nw a sp u r i f i e db yg l u t a t h i o n es e p h a r o s e4 b r e l a t i v e m o l e c u l a rw e i g h ta n di m m u n i t yw e r ei d e n t i f i e db yw e s t e r nb l o t t h ef i r s ta n t i b o d yi s s e r u mo fr a b b i tw h i c hw a si m m u n i z e db ym e t h es e c o n da n t i b o d yi si g g - h r pw h i c h i sa i m e da tt h ef i r s ta n t i b o d y 5 r e s u l t s 1 a m p l i f i c a t i o na n di d e n t i f i c a t i o no f 116d e s t i n a t i o ng e n e t h ep c rp r o d u c to fm u t a t i o nf r a g m e n ti s17 6 b p t h ep c rp r o d u c to f116 d e s t i n a t i o ng e n ei s5 9 7 b p t h e ya r ec o r r e s p o n d 、析t 1 1r e f e r e n c ev a l u e 2 i d e n t i f i c a t i o no fp m d t - 116c l o n i n gv e c t o r t h ec l o n i n gv e c t o rc o n t a i n i n gt h eo b j e c tg e n ef r a g m e n tw a su s e da st h et e m p l a t et o p c r a m p l i f i c a t i o n w eo b t a i n e dab a n do ft h es a m em o l e c u l a rw e i g h ta st h ei n s e r tg e n e f r a g m e n t c l o n i n gv e c t o rw a sd i g e s t e dw i t hb a m h l 、e c o r le n z y m ea n dg e n e r a t e d t w o2 7 k ba n d0 6 k bb a n d s t h eo b j e c t g e n ef r a g m e n t i ss a l t l e 谢t ha m i n oa c i d s e q u e n c e so fm pp 116e x c e p tm u t a t i o nb a s i cr a d i c a l 3 c o n s t r u c t i o na n di d e n t i f i c a t i o no fm p e x p r e s s i o nv e c t o r t h ee x p r e s s i o nv e c t o r c o n t a i n i n gt h eo b j e c tg e n ef r a g m e mw a su s e da s t h e t e m p l a t et op c ra m p l i f i c a t i o n w eo b t a i n e dab a n do ft h es a m em o l e c u l a rw e i g h ta s t h ei n s e r tg e n ef r a g m e n t e x p r e s s i o nv e c t o rw a sd i g e s t e dw i t hb a m h l 、e c o r le n z y m e a n dg e n e r a t e dt w oo 6 b pa n d5 8 k bb a n d s ,d i g e s t e d 晰t l le c o r l 、x h o ie n z y m ea n d g e n e r a t e dt w o0 9 b pa n d5 5 k bb a n d s ,d i g e s t e d 嘶t l lb a m h 1 、x h o ie n z y m ea n d g e n e r a t e dt w o1 5 k ba n d4 9 k bb a n d s 4 d e t e c t i o no f a n t i g e n i c i t yo f r e c o m b i n a t i o n p r o t e i n t h et h e o r e t i c a lm o l e c u l a rm a s so ft h ep r o t e i nw a sc a l c u l a t e dt ob e81k d ab y s d s - p a g e i ti si d e n t i c a lt ot h et h e o r yv a l u e w e s t e r nb l o t t i n gs h o w st h a ta n t i m p p o l y c l o n a la n t i b o d i e sr e a c t e dt oam a j o rb a n d 、析t ham o l e c u l a rm a s so f81k d a c o n c l u t i o n i t h i sd e s t i n a t i o n g e n e o fm p116 p r o t e i n w a st a k e n b yg e n e m u t a t i o n ( t g a t g g ) o fp c r 2 d o u b l ep r o t e i nm u l t i - e p i t o p ee x p r e s s i o nv e c t o rp1 - - p116w a sc o n t r u c t e da n d s h i r e di ne c o l it oe x p r e s s e ds t e a d i l yf u s i o n p r o t e i n 3 w e s t e r nb l o t t i n gc o n f o r m e dt h a t81k d ae x p r e s s i o np r o t e i no fr e c o m b i n a n t c l o n er e a c t e dt oa n t i m pp o l y c l o n a la n t i b o d i e s k e vw o r d s m y c o p l a s m ap n e u m o n i a e ;e p i t o p e ;g e n ec l o n i n g ;p 116 6 英文缩略语 7 论文 肺炎支原体多抗原表位表达载体的构建与鉴定 刖昌 肺炎支原体( m y c o p l a s m ap n e u m o n i a e ,m p ) 是人类原发性非典型肺炎的病原 体,还可引起及其他呼吸道感染性疾病甚至机体其它组织疾病【l 】。由于m p 无细 胞壁,故其引起感染的治疗与其它细菌和病毒感染在治疗方法上有所不同,因此, m p 感染的病源学诊断对于疾病的及时正确治疗有重要意义。 目前检测肺炎支原体的方法虽然很多,但仍缺乏更为快速简易可靠的方法。 血清学检测以检测不同种类的抗体为基础,是目前m p 感染诊断应用较为广泛的 一种方法。但是常规血清学诊断方法所用抗原系由完整的支原体成分制备,而支 原体难以大量培养,抗原制备困难,而且m p 细胞膜上的糖脂抗原与其它微生物 及机体组织存在非特异交叉反应,血清学检测易出现假阳性【2 】。为解决m p 感染 血清学诊断抗原的问题,应用基因工程的方法克隆m p 蛋白抗原基因,从克隆株 中提取纯化蛋白作抗原,用于m p 感染的诊断,可以提高敏感性和特异性【3 】。m p 细胞表面的p 1 、p 1 1 6 粘附蛋白是肺炎支原体与宿主细胞受体结合的主要粘附蛋白, 为m p 致病的重要因剥3 1 ,也是刺激机体产生免疫反应的主要免疫原。1 7 0 k d a 的 p 1 蛋白含有多个抗原决定簇,可在肺炎病人中引起强烈的免疫反应1 4 ,是m p 免 疫诊断的优选抗原。目前国内外已有人成功构建了m p p l 蛋白的表达载体1 5 , 6 】,用 其检测临床标本,与全茵抗原相比,有较高的特异性和敏感性。但是p 1 粘附因子 和生殖支原体1 4 0 k d a 蛋白之间有共同抗原,与真核生物结构蛋白也有一定同源 性,所以用完整的肺炎支原体菌体成分或完整的p 1 蛋白作抗原易出现非特异性交 叉反应,而且p 1 黏附蛋白的羧基端仅含有三个预测抗原表位,相对于全菌抗原来 说抗原表位仍少。p 1 1 6 蛋白为含有1 0 3 0 个氨基酸的m p 表面蛋白,也具有黏附 特性和免疫反应性,其与生殖支原体之间的免疫交叉反应低【_ 7 1 。选取p 1 1 6 蛋白特 异抗原表位区作为目的基因,与含有p 1 蛋白抗原表位的表达载体重组,将会增加 重组蛋白的特异抗原表位,用于临床研究,有望提高诊断的敏感性和特异性。 8 本研究在原实验室的研究工作基础之上,经p c r 点突变技术( t g a - - * t g g ) 获 取m p1 1 6 蛋白目的基因,构建了m pp 1 p 1 1 6 双蛋白多抗原表位表达载体,这种 双蛋白多表位重组体的成功表达,将会为研制特异、敏感的肺炎支原体诊断试剂 奠定基础。 材料和方法 一、实验材料 l 、质粒和菌株 m pf h 株、大肠杆菌由实验室保存,表达载体p g e x 6 p 1 p 1 由原实验室制 各。 2 、主要试剂 t a qp c r 试剂盒、b a m h i 酶、e c o r i 酶、t 4 d n a 连接酶、d n a 凝胶回收试 剂盒、质粒提取试剂盒均购自大连宝生物工程有限公司;g l u t a t h i o n es e p h a r o s e4 b ; 羊抗兔i g g h r p 。 3 、引物 根据g e n b a n k 提供的m p l l 6 蛋白基因序列,通过引物分析软件p r i m e r 5 ,0 和 o l i g 0 6 设计3 条引物。 4 、主要仪器 p c r 扩增仪,低温高速离心机,垂直及水平凝胶电泳设备,超声粉碎仪,l g1 5 一w 型高速台式离心机,振荡混合仪,g d s 8 0 0 0 型凝胶成像仪,h h w 2 1 c u 6 0 0 型电热恒温水温仪,超净工作台,冰箱,3 7 c 培养箱。 二、实验方法 ( 一) 目的基因的制备 1 、d n a 模板的制备 将m pf h 菌株接种于7 0 m lh a y f l i c k s 培养基,3 7 c 培养7 2 h ,判断生长良 好后,吹打瓶壁混匀培养物,4 。c1 0 ,0 0 0 r p m 离心2 0 m i n ,弃上清。用p b sb u f f e r 洗涤沉淀3 次,离心,弃上清后,沉淀用2 7 m lp b sb u f f e r 悬起。加入0 3 m l1 0 s d s 和1 0 0 9 9r n a s e ,3 7 。c 孵育3 0 m i n 。用平衡酚抽提3 次,再用氯仿一异戊 9 醇抽提1 次,吸取上清,沉淀自然干燥,用1 0 0 1 a l t e b u f f e r 溶解d n a 。取5 “l 电 泳,检测提取的d n a 浓度,- - 2 0 冻存备用。 2 、p c r 点突变获取目的基因 ( 1 ) p c r 扩增p 1 1 63 端突变片段 p c r 反应条件为:9 5 5 m i n x l ;9 5 3 0 s ,5 5 3 0 s ,7 2 4 0 s x 3 0 ; 7 2 1 0 m i n x l 。反应体积为5 0 1 x l ( 如表1 所示) 。 1 琼脂糖凝胶电泳鉴定:称取0 3 9 a g a r o s eg e l ,加入3 0 m l1 t a eb u f f e r , 加热溶解。铺板,在溶解好的凝胶中加入终浓度为0 5 1 a g m l 的溴化乙锭水溶液, 待胶凝固后,将凝胶放入盛有电泳液的槽中。取5 l 扩增产物与载体缓冲液混合 并加入凹孔中。以d n a m a r k e r d l 2 0 0 0 作分子量对照,8 0 v 电泳3 0 m i n 后,分析 p c r 扩增情况。 回收p c r 产物: 吸取p c r 反应液4 0 i - t l ,加6 0 i t ld h 2 0 ; 加入5 0 1 a l 平衡酚,5 0 _ t l 氯仿,10 ,0 0 0 r p m ,5 m i n ,离心; 吸取上层水相10 0 i - t l ; 加入1 0 i - t l3 mn a c l ,混匀,再加2 0 0 p 1 冷无水乙醇,混匀,1 2 ,0 0 0 r p m , 1 0 m i n ,离心,弃上清,干燥; 沉淀溶于2 0 1 a ld h 2 0 中。 ( 2 ) p c r 扩增m p1 1 6 目的基因片段 p c r 反应条件为:9 5 5 m i n l ;9 5 1 m i n ,6 5 1 m i n ,7 2 l m i n x 3 2 ;7 2 1 0 m i n x l 。反应体积为5 0 i t l ( 如表2 所示) 。 1 琼脂糖凝胶电泳鉴定:称取0 3 9a g a r o s eg e l ,加入3 0 m llx t a eb u f f e r , 加热溶解。铺板,在溶解好的凝胶中加入终浓度为o 5 咖l 的溴化乙锭水溶液, 待胶凝固后,将凝胶放入盛有电泳液的槽中。取2 0 t l 扩增产物与载体缓冲液混合 并加入凹孔中。以d n a m a r k e r d l 2 0 0 0 作分子量对照,1 0 0 v 电泳4 0 m i n 后,分 析p c r 扩增情况。并割下含有目的基因片段的凝胶条,用d n a 凝胶回收试剂盒 进行目的片段的回收,具体操作参照d n a 凝胶回收试剂盒附带的说明书。 1 0 表1 ,p c r 扩增p 1 1 63 端突变片段反应体系 m p d n a 2 9 l 10 x p c rb u f f e r 5 9 l d n t p $ 4 u l 引物2 ( 3 端引物,6 8 1 u n o l o )3 p l 引物3 ( 突变引物,6 8 r t m o l 1 )3 p l d i - 1 2 0 3 2 5 9 l t a q 酶0 5 9 l t o t a l 5 0 9 l 表2 ,p c r 扩增m p1 1 6 目的基因片段反应体系 口d n a 1 0 x p c rb u 艉r d n t p s 引物1 ( 5 端引物,6 8 9 m o l 1 ) 回收p c r 产物 d h 2 0 t a q 酶 t o t a l 表3 ,p c r 反应引物 2 9 l 5 9 l 4 9 l 8 9 l 2 0 i _ t l l o g l l “l 5 0 9 l 引物序列p c r 产物大小 下游引物5 a t a t g a a t t c t t t g a a g c c c a t g t c a g t a a a g - 3 ( e c o r i ) 突变引物5 g a c c t t t g g t t g t r t a a g a m g g c c t f 认g t t c 3 上游引物5 肼g g a t c c t t c a a a g a t a a c a t c c a a g t g - 3 ( b a m i ) 大引物回收突变片段 1 7 6 b p 5 9 7 b p ( 二) m p1 1 6 克隆载体的构建与鉴定 l 、e c o l ij m l 0 9 感受态菌的制备 将e e o l ij m l 0 9 菌株接种于5 m l l b 液体培养基中,3 7 。c 过夜培养,按1 接 种于2 0 m ll b 培养基中,3 7 c 振荡培养3 h 。4 0 0 0 r p m ,离心1 0 m i n ,弃上清。菌 体沉淀加入1 0 m l4 。c 预冷的7 5 m m o l lc a c l 2 溶液,轻柔吹打菌悬液,冰浴3 0 m i n 。 4 0 0 0 r p m ,离心1 0 m i n ,弃上清。菌体沉淀加入2 6 7m l4 。c 预冷的7 5 m m o l lc a c l 2 溶液,冰浴4 h 。4 保存。 2 、克隆载体的构建 l m le p 管中加入:p m d t v e c t o rl g l ,目的片段回收产物8 9 l ,s o l u t i o n 9 1 x l 1 6 4 5 m i n ; 加入1 0 0 9 l 感受态菌,冰浴3 0 m i r a 4 2 水浴4 5 s ,冰浴l m i m 加入5 0 0 9 ll b ,3 7 。c 震荡培养6 0m i n ,涂四块a m pl b 琼脂平板,3 7 。c 过 夜培养。 挑取平板上单个菌落,接种于5 m l 含氨苄青霉素的l b 液体培养基( 1 0 0 9 9 r r d ) 中,3 7 。c 培养过夜,用质粒提取试剂盒提取重组质粒,具体操作参照质粒提取 试剂盒附带的说明书。 3 、克隆载体鉴定 ( 1 ) 酶切指纹图谱鉴定 将提取的p m d t - 1 1 6 重组质粒和p u c l 9 载体进行酶切,如表4 加样: 表4 ,克隆载体酶切鉴定 3 7 水浴l h ,6 5 。c 水浴1 0 m i n ,4 。c 8 m i n 终止反应。l 琼脂糖凝胶电泳检测。 ( 2 ) p c r 扩增鉴定 以提取的p m d t - 1 1 6 重组质粒为模板,p c r 扩增插入片段。 1 2 p c r 反应条件为:9 5 5 m i n x l ;9 5 l m i n ,6 5 l m i n ,7 2 l m i n x 3 2 :7 2 1 0 m i n x l 。反应体系为5 0 9 l ,如表5 所示。l 琼脂糖凝胶电泳鉴定。 表5 ,p m d t - 1 1 6p c r 扩增: p m d - t - 11 6 1 0 p l 1 0 x p c rb u f f e r 5 1 a l d n t p s 4 9 l 引物1 ( 6 8 t t m o l l ) 8 9 l 引物2 ( 6 8 1 u n o l l ) 8 9 l d h 2 01 4 9 l taq酶lg l t o t a l 5 0 9 l 4 、重组质粒d n a 测序鉴定 南京金思特科技公司测定p m d t - 1 1 6 重组质粒的核苷酸序列,与g e n b a n k 提 供的f h 株肺炎支原体p 1 1 6 基因序列进行同源性比较。 ( 三) m p 多抗原表位表达载体的构建与鉴定 l 、p 1 p 1 1 6 的构建 ( 1 ) 酶切,如表6 加样。 表6 ,p 1 p 1 1 6 构建 3 7 。c 水浴l h ,6 5 。c 水浴1 0 m i n ,4 。c 8 m i n 终止反应。1 琼脂糖凝胶电泳检 测,用d n a 凝胶回收试剂盒回收p m d t - 1 1 6 重组质粒酶切片段( 即目的基因片 段,电泳中5 9 7 b p 片段) 和p g e x

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

评论

0/150

提交评论