新分子检测技术在肺癌精准治疗中的应用NGS vs ddPCR

1、将分子检测新技术在肺癌精确治疗中的应用与ddPCR、李思思等进行了比较。测序技术的发展带来了靶向治疗的深入研究，而聚合酶链反应技术也经历了三代进化。1987年，KRAS基因突变在当时50%的肺腺癌患者中被发现。2004年，EGFR突变被发现作为肺腺癌的一个新的驱动基因。2014年，随着TCGA项目的完成，肺腺癌基因突变图谱得到进一步完善。随着分子检测技术的进步，对非小细胞肺癌驱动基因的认识不断加深。Ashley J. Vargas等人，自然评论癌症16，525-537(2016)，遗传易感性，早期筛查，伴随诊断的药物指导，复发和疾病进展的监测，血液，组织，良性和恶性判断，NGS在癌症临床领域的

2、应用，遗传易感性，早期筛查，伴随诊断的药物指导，复发和疾病进展的监测，良性和恶性或分子分类，NGS在肺癌临床领域的应用，NGS NGS，ddPCR，NGS，ddPCR，NGS，NGS，肿瘤异质性挑战传统的分子组织诊断。计算ngs和ddPCR，等位基因突变频率(AF)通过观察检测到的具有突变的DNA(突变体)和所有检测到的DNA(野生型突变体)的比率来确定。等位基因突变频率=4/14=28.5%的未突变DNA来自正常组织或肿瘤中的其他亚克隆。NGS和ddPCR可以报告等位基因突变频率，反映不同亚克隆之间的比例关系。、EGFR L858，通过等位基因突变频率，结合样本中肿瘤的病理评价，有助于了解肿

3、瘤异质性。NGS和ddPCR可以区分分子顺式/分子反式，K. S. Thress，等. NAT Med，2015.21 (6) :第560-562页。一些研究发现T790M和C797S突变的分子顺式/分子反式信息影响EGFRTKI的治疗效果。NGS和ddPCR可以提供EGFR突变的incos/itran信息，具有重要的临床意义，但传统的PCR检测会遗漏这一信息；NGS基于目标捕获可以同时检测已知突变和未知突变。ddPCR、热点1、热点2、热点3、热点4，并检测基因。NCCN指南建议新诊断的患者应该进行多目标平行检测，并且八个非小细胞肺癌的NGS基因可以被完全覆盖。MET 14外显子跳跃、HER

4、2 20外显子插入等。是复杂的突变。EGFR和其他热点基因的非热点突变位点是不寻常的融合模式。大约3/4 ALK融合是经典的EML4-ALK融合，但1/4是与其他基因的融合。包括strn-alk cats perb-alk CVR 1-alk clip 1-alk dph 6-as1-alk kif 5 b-alk rp11-320m 2.1-alk ugp 2-alk，稀有的EGFR-19Del可能引起聚合酶链反应方法的假阴性，NGS可以覆盖传统方法和ddPCR不能检测的突变物种，NGS可以发现新的耐药机制。第一代有15名患者出现TKI病，T790M。使用AZD9291后，发现有三种类型的耐

5、药性：6例出现C797s，5例仍保持T790M，没有C797S T790M消失。2015年6月；21.发现了获得性耐药的机制。与EGFR不同，ALK-TKI的抗性机制更复杂，NGS检测EGFR和ALK的抗性位点不成问题。DdPCR只能检测T790M，一个相对集中的耐药位点。随着数据库构建技术和生物信息学分析策略的发展，NGS液体活组织检查的灵敏度已经远远超过了ddPCR。在肿瘤克隆进化过程中，耐药相关亚克隆L1198F恢复了对克唑替尼的敏感性。2016；374(1):54-61。鲍迪等，英国医学杂志。2016；374(18):1790。评论：与临床重复活检面临的巨大挑战相比，ctDNA动态随访是监测肿瘤克隆演变的最佳方法，NGS检测有助于分析肿瘤克隆的演变，N. Rizvi等，Science，Vol. 348，2015，全外显子测序结果有助于评估接