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文档简介
第三章DNA的复制第2节复制叉第2节-复制叉2.复制叉2.1DNA双链的合成:
复制叉(replicationfork):刚分开的模板链与未复制的双链DNA间的连接区。5′5′3′3′LeadingstrandPrimerOkazakifragmentDNApolymeraseDirectionofreplicationDirectionDirectionLaggingstrandP211第2节-复制叉2.复制叉2.2RNA引物:
①DNA聚合酶不能从头合成DNA②RNA聚合酶从头合成RNA③引物酶(primease)合成RNA。无DNA序列特异性。5-10nt第2节-复制叉2.复制叉2.3RNA引物的去除:①RNaseH:核糖核酸内切酶,可以特异性地水解DNA-RNA杂合链中的RNA。②RNaseH:只能断裂2个核糖核苷酸之间的酯键。TemplateATPP212第2节-复制叉2.复制叉2.4DNA解旋酶:①DNA解旋酶的极性(polarity):,每个DNA解旋酶在单链DNA上都沿着一定的方向运动。
5′→3′or3′→5′
与DNA解旋酶结合的DNA链决定方向
ATP提供能量DoubleP213第2节-复制叉P213第2节-复制叉2.复制叉2.4DNA解旋酶:②作用机制(如何移动DNA的)Papillomavirus:乳头瘤病毒,E1蛋白nucleotideDNATopATPMiddleADPBottomTopATP1.3nm发夹P215第2节-复制叉2.复制叉2.5DNA单链的稳定:
单链DNA结合蛋白(SSB,single-strandedbindingprotein)
协同结合(cooperativebinding)
结合DNA是非特异性静电和疏水作用
结合后DNA处于伸直状态第2节-复制叉2.复制叉2.6DNA超螺旋的去除:第2节-复制叉小结1.复制叉
Leadingstrand
Laggingstrand
Okazakistrand2.RNA引物
RNAprimase
RNaseH3.DNAhelicase4.SSB
Cooperativebinding5.DNAtopoisomerase第2节-复制叉作业什么是复制叉?RNase的特点是什么?什么是DNA解旋酶的极性?第2节-复制叉第3节DNA聚合酶的种类和复制叉DNA的合成第2节-复制叉3.1DNA聚合酶的种类3.1.1原核生物DNA聚合酶
亚基功能
PolI1RNA引物的去除,DNA修复
PolII1DNA修复
PolIII(核心)3DNA复制
PolIII(全酶)9DNA复制
PolIV1DNA修复,移损合成
PolV3移损合成P219第2节-复制叉3.1DNA聚合酶的种类3.1.2真核生物DNA聚合酶
亚基功能
Polα4合成引物
Polβ1DNA修复
Polγ3线粒体DNA复制与修复
Polδ2-3DNA复制与修复
Polε4DNA复制与修复
Polθ1DNA修复
Polζ1移损合成
Polλ1DNA修复P220第2节-复制叉3.1DNA聚合酶的种类3.1.2真核生物DNA聚合酶
亚基功能
Polμ1体细胞超变
Polκ1移损合成
Polη1移损合成
Polτ1移损合成,体细胞超变
Rev11移损合成
Polα4合成引物
Polδ2-3DNA复制与修复
Polε4DNA复制与修复第2节-复制叉3.1.2真核生物DNA聚合酶
Polα:2亚基DNA聚合酶α和2亚基引物酶
Polδ&Polε
:高延伸性的聚合酶
Polδ:LaggingstrandPolε:Leadingstrand
聚合酶切换:聚合酶δ或聚合酶ε取代聚合酶α/引物酶的过程聚合酶切换第2节-复制叉3.1DNA聚合酶的种类3.1.3滑动夹增强DNA聚合酶延伸能力proliferatingcellnuclearantigen(PCNA)P221-222第2节-复制叉3.1DNA聚合酶的种类3.1.3滑动夹增强DNA聚合酶延伸能力P223第2节-复制叉βsubunitsofE.coliPolyIIIholoenzymeT4phagegp45EukaryoticPCNA3.1DNA聚合酶的种类3.1.3滑动夹增强DNA聚合酶延伸能力
功能的保守
结构的保守P224第2节-复制叉3.1DNA聚合酶的种类3.1.4滑动夹装载器(slidingclamploader)
E.coli:γ复合体
Eukaryotic:复制因子C(RF-C)①结合ATP②结合并打开滑动夹③结合DNA
滑动夹套住DNA
水解ATP④滑动夹装载器脱离DNA5subunits滑动夹装载器的作用过程第2节-复制叉小结3.1.1原核生物DNA聚合酶3.1.2真核生物DNA聚合酶3.1.3滑动夹3.1.4滑动夹装载器(slidingclamploader)第2节-复制叉1.DNAhelicase2.SSB
Cooperativebinding3.DNAtopoisomerase4原核生物DNA聚合酶5真核生物DNA聚合酶6滑动夹7滑动夹装载器(slidingclamploader)第2节-复制叉3.2ThereplicationofDNAatfork--elongation3.2.1DNA聚合酶III全酶(PolyIIIholoenzyme)
全酶是核心酶和对其有增强功能的其他元件的多蛋白复合体的总称。
全酶构成核心DNA聚合酶III核心DNA聚合酶III滑动夹夹子装载器P227第2节-复制叉3.2ThereplicationofDNAatfork3.2.1DNA聚合酶III全酶(PolyIIIholoenzyme)
全酶构成
1.核心DNA聚合酶III22.γ复合体1
2.1τ-蛋白2第2节-复制叉3.3复制体3.3.
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