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文档简介

1、 实验的步骤实验的步骤: GDF15基因的提取及PCR扩增 载体质粒的提取(细菌的培养和质粒的提取) 双酶切 连接 转化到细菌(感受态的制备) 双酶切鉴定,基因测序鉴定 扩大培养细菌和重组质粒提取 病毒制备 1. 转染细胞筛选稳定表达GDF15蛋白的细胞 Gdf15基因所在细胞的RNA的提取 反转录cDNA Gdf15基因引物设计(注意要加上酶切位点序列) PCR扩增Gdf15基因 凝胶电泳及PCR产物回收 利用Vector NTI 8.0软件设计NPM1基因序列扩增引物, 在引物两端分别加EcoR I、BamH I酶切位点和3个保护 碱基 引物名称 序列 , FWDGCGGAATTCATGG

2、AAGACTCGATGGATATGGACATG , REVGCGGGATCCTTAAAGAGATTTCCTCCACTGCCAGAG 下划线标示出限制性酶切位点 / Addgene: pLJM1-EGFP 举例: 1细菌: Stbl3菌株、DH5菌株 2质粒 pCDNA3.1质粒、pLJM1质 粒、V51-S3质粒 甘油菌种(甘油菌种(-80-80度保存)度保存)1ml 1ml 方法一:方法一: 直接取直接取10ul10ul至至4ml4ml培养基培养基中,中, 加上相应加上相应抗生素抗生素,进行培养,进行培养 (3737度度250 rpm250 rpm培

3、养培养12 h12 h左右)左右) 然后做个菌落然后做个菌落PCRPCR,如果有目,如果有目 的条带,拿去测序。当然如果的条带,拿去测序。当然如果 以前做过测序的话,就不需要以前做过测序的话,就不需要 再测啦。再测啦。 超净工作台、酒精灯、移液枪、超净工作台、酒精灯、移液枪、 灭菌锅、试管、三角烧瓶、恒灭菌锅、试管、三角烧瓶、恒 温摇床温摇床 试剂试剂 LB培养基:培养基: Tryptone 10 g/L , Yeast extract 5 g/L, NaCl 5 g/L(ph7.4-7.6) 抗生素:抗生素:氨苄、卡那霉素 灭菌接种环灭菌接种环 沾取标本沾取标本 接种划线接种划线 37度培养

4、过夜度培养过夜 方法二:平板划线接种法方法二:平板划线接种法 挑取单克隆挑取单克隆 扩大培养扩大培养 灭菌锅、三角烧瓶、平板皿、超净工作台、灭菌锅、三角烧瓶、平板皿、超净工作台、 接种环、酒精灯、恒温培养箱、移液枪、接种环、酒精灯、恒温培养箱、移液枪、 试管、恒温摇床试管、恒温摇床 试剂试剂 LB固体培养基:固体培养基: Tryptone 10 g/L , Yeast extract 5 g/L, NaCl 5 g/L(ph7.4- 7.6)琼脂琼脂1.5% 抗生素:抗生素:氨苄、卡那霉素 注意:注意: 。 方法一:SDS碱裂解法少量抽提质粒DNA 裂解:裂解: 取1.5 mL菌液离心(120

5、00 rpm,1 min), 尽可能地吸干培养液。将沉淀重悬于 150ul的碱裂解液碱裂解液I I中,剧烈振荡。 加入200 ul现配的碱裂解液现配的碱裂解液II II,轻轻地快速颠倒混匀5次,冰浴5min。 从冰箱中取出碱裂解液碱裂解液IIIIII,加入150ul至EP管中颠倒混匀,冰浴5 min后离心。 加入等体积的酚和氯仿酚和氯仿后离心,小心地吸取上清液到新的管中。 回收质粒回收质粒DNADNA: 加入双倍体积的无水酒精无水酒精,充分混匀后,冰浴3h。4度离心10 min,弃上清。 加入1 mL的70%70%的无水酒精的无水酒精清洗一次,4 C, 12000 rpm离心10 min,弃上

6、清, 将开口的EP管于室温下使酒精挥发,约10 min左右。用50 ul的RNARNA酶酶(40 uL/mL)的ddH2O重新溶解核酸,温和的振荡几秒,-20度保存备用。 琼脂糖凝胶电泳:琼脂糖凝胶电泳: 离心机离心机、移液枪、冰盒、移液枪、冰盒、EPEP管等管等 试剂试剂 碱裂解液碱裂解液: 50nmol/L 葡萄糖,25mmol/L Tris-Cl(pH 8.0),10mmol/L EDTA(pH8.0)。 碱裂解液碱裂解液: 0.2N NaOH(从10N贮存液中现用现稀释);1%(m/V)SDS 碱裂解液要现用现配制,室温下使用。 碱裂解液碱裂解液: 5mol/L乙酸钾 60ml;冰乙酸

7、11.5ml;H2O 28.5ml,保存在4 C。 方法二、质粒小抽试剂盒(天根、方法二、质粒小抽试剂盒(天根、Axgen) 简单快速方便、价格也便宜简单快速方便、价格也便宜 EcoR I EcoR I 和和BamH I BamH I 双酶切双酶切 用限制性内切酶EcoR I 和 BamH I 双酶切载体V51-S3 和NPM1基因片段,37 C,4 h。 酶切产物回收(胶回收试剂盒) 将NPM1基因双酶切片段与线 性化载体V51-S3连接重组, 16水浴连接过夜。 1)取10 L连接产物加入到100 l E.coli DH5E.coli DH5感受态感受态中, 轻轻吹打混匀,冰上放置30 m

8、in; 2) 4242热激热激90 s90 s,冰浴,冰浴5 min5 min; 3) 加入1 mL 37预热的LB液体培养基,37,250 rpm 摇菌复苏复苏1 h; 4) 3000 rpm离心2 min,吸去上清,剩余100 L 菌液用移 液枪吹打重悬菌体,涂布于LB/氨苄青霉素(100g/ml) 平板上(涂平板),(涂平板),37正置培养正置培养30 min,然后倒置培养 12 h左右; 5) 挑转化后的若干个单克隆菌落若干个单克隆菌落接种到4 mL LB/氨苄青 霉素(100 g/ml)液体培养基中,37,250 rpm培养12 h 左右,用于提取质粒。 1) 挑E.coli DH5

9、单克隆菌落接种到4mL LB液体培养基中, 37,250 rpm摇菌12-14 h; 2) 接种2 mL培养的菌液到含有100 mL LB液体培养基培 养瓶中,37,250 rpm摇菌至摇菌至OD600OD600为为0.3-0.50.3-0.5; 3) 将菌液倒入50 mL灭菌离心管中,冰浴冰浴20 min后,4, 3000 rpm离心10 min; 4) 吸去上清,用20 mL20 mL冰冷的冰冷的50 mM CaCl50 mM CaCl2 2溶液轻轻重悬溶液轻轻重悬 菌体菌体,冰浴30 min; 5) 4,3000 rpm离心10 min,吸去上清,用4 mL4 mL冰冷的冰冷的 CaCl

10、CaCl2 2溶液(溶液(3.25 ml 50 mM CaCl3.25 ml 50 mM CaCl2 2溶液和溶液和0.75 mL 80%0.75 mL 80%甘油混甘油混 合)轻轻重悬菌体合)轻轻重悬菌体,即为感受态细胞; 6) 每管100 L分装于1.5 mL离心管中,-80保存备用。 基因测序鉴定 碱裂解法大量抽提质粒(200+ml 菌液) 1) 细胞转染前将293T293T细胞细胞以1.5106的密度培养于10 cm细胞培 养皿中培养24 h,保证转染时细胞汇合度达到50%-60%。 2) 转染前3 h将待转染细胞培养基换为无血清无血清MEMMEM培养基培养基。 3) 取16 g质粒(

11、7.5g pLKO.1;2.9 g PCMV-VSVGPCMV-VSVG;5.6 g 5.6 g PCMV-dR8.2PCMV-dR8.2)至0.5 ml无血清MEM培养基中,轻轻吹打混合 均匀。再取15L LipofectamineLipofectamine 2000 2000至0.5 mL无血清MEM培 养基中,轻轻吹打混合均匀,室温孵育5 min。混合两份培养 基(总体积1.0mL)轻轻吹打混合均匀,室温孵育25 min。 4) 在待转染细胞中加入4 ml无血清培养基,逐滴加入步骤3的 混合液。轻轻晃动培养皿使溶液混均,放至37,CO2培养箱 中培养6 h后换成10%血清的DMEM培养基培养。 5) 48 h后收集病毒,取上清培养基至15 mL离心管中,2000 rpm, 4离心7 min收集上清,4保存,如需长期

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