生物工程信息检索期末作业

1、文献检索期末作业一首先大体介绍一下我的课题： 我的课题：杂色云芝菌产漆酶的发酵优化 我的课题研究背景：漆酶（laccases），是一种含铜的多酚氧化酶，与植物抗坏血酸氧化酶、哺乳动物血浆铜蓝蛋白和胆红素氧化酶等同属蓝色多铜氧化酶家族。按漆酶来源可分为漆树漆酶和真菌漆酶两大类。漆酶在真菌、植物、原核生物等都有发现，特别是在大型真菌如担子菌、子囊菌和半知菌等中发现较多。此外，在高等动物中也有发现，如最近Ferrer等从牛胃中鉴定获得一新的漆酶。本文我所研究的产漆酶真菌是杂色云芝菌，其属于丝状真菌白腐真菌类，漆酶不但具有氧化酚类，芳胺类化合物、与木质素有关的非酚类化合物的能力，氧化高难降解的环境污染

2、物的能力，还具有特殊的催化性能，能催化有机物的合成。与化学氧化相比，由于生物氧化具有特异性、可降解性，以及反应条件的温和性等优点，大大的节约了能源和成本，使得漆酶在工业，农业和生物技术领域具有广阔的应用前景。漆酶的应用很广泛，是一种重要的酶制剂，但是研究其存在的最大问题就是酶活较低，所以我的课题的研究就是如何较大幅度的提高漆酶酶活。漆酶的生产方法主要是真菌发酵法,包括液体发酵和固体发酵。目前研究较多的是深层振荡液体发酵。液体发酵产漆酶条件研究的主要内容有:营养因子、非营养因子的优化及诱导剂的筛选等。营养因子主要包括碳源、氮源、无机盐、微量元素和维生素等;非营养因子主要有pH,温度等。所以本课题

3、重点就是从营养因子，对该菌产漆酶酶活的影响进行探索，试图找到该菌产漆酶的最优条件。二 下面举一例对研究课题时，进行文献检索的过程进行分析。案例分析一课题研究，需要检索：杂色云芝菌产漆酶的发酵优化我的检索思路为：图书阅读中文检索外文检索整理思路确定，实验方向2.1首先进行图书阅读，大体了解课题的相关内容。选择超星电子图书选择其理由：超星电子图书（百万包库）远程访问，图书资源100万种，涵盖中图法22大类，基本涵 盖了近几年出版的所有图书。 进入超星电子图书界面，在高级检索中输入关键词“漆酶优化”“真菌培养”，都没有找到相关图书： 所以打算直接检索“真菌”，再检索“酶”，试图找到相关图书，找准其中

4、几本图书，点击阅读器进行阅读或者网页阅读，对真菌的培养，生长和酶活测定，产酶条件进行大体的了解。2.2 进行中文检索。选择CNKI中国知网。选择其原因：是因为中国知网的学术期刊、其中有国内相关资源最完备、高质量、连续动态更新的中国优秀硕士学位论文全文数据库，让我们了解自己课题的进展方向。 A、CNKI检索过程 打开南京工业大学图书馆，选择中文数据库，点击总库平台，进入知网主页。 选择高级检索，进入高级检索页面，提高自己检索的查全查准率。考虑课题：杂色云芝菌产漆酶的发酵优化 的核心内容为：漆酶优化选取主题选项，在后面输入框中输入：(漆酶)，后并含框中输入(优化)，后在匹配中选择模糊。 检索结果，

5、发现有522篇相关的文献，其中有多数与我的课题中心：白腐菌产漆酶优化的相关性不大，估计参考值较低，故需要修改检索策略。修改的检索策略：在漆酶优化这个检索条件的基础上，有添加了3个检索条件，为了能对相关文献查的更全更准确。具体分析：我的课题主题是漆酶优化，但是好多文献的说法还可以说成：对产漆酶条件的探索，故漆酶优化的同义可为漆酶条件，两者的关系选择或含；出于想缩小范围，更加准确的检索的目的，我又添加另一关键词：白腐真菌，而白腐真菌有是一种丝状真菌，两个为同义；这四个输入内容均为词组，我都为它们匹配为精确。故我确定的布尔逻辑如下图。一共检索出26结果。 （5）点击进入一篇文章，查看相对应的摘要，和

6、我所研究的课题主题相关性很大，选择CAJ：检索完成。 2.3前期运用中国知网:对杂色云芝菌产漆酶的发酵优化这个主题的现阶段研究成果、进展、未来趋势和方向有了较为全面认识，但是想对自己下阶段的实验计划和实验方案有创新突破，还需进一步阅读大量的外文文献，所以决定继续进行外文检索。 选择Web of Science 检索 选择原因是：该数据库收录国外核心期刊比较全面，在国内外的数据库中处于高影响的地位，对自己的论文设计有很大的用处。 Web of Science检索过程 打开Web of science 界面，添加另两个字段，输入关键词“laccase ”、“optimization” or“whi

7、te-rot fungus”，它们的逻辑顺序均为and：（2）检索结果，共有143条记录，选择排序方式为“相关性”，找到和自己检索主题相关性较大的文献： 点击进入任意一条记录中，然后大体阅读一下摘要内容，看看是否是我需要的文献： 是我主题相关的文献，点击出版商处的全文: 选择下载，即可：检索完毕。 之后仔细对前期文献进行归纳总结，确定自己的实验思路与论文方向。四对本课程的建议与意见评价：文献检索的课程结束了，我觉得这个课程的意义还是很大的。在我大学本科的时候，那时以上课为主，用到文献检索的地方相对较少，只有在图书馆借书还书的时候感受到图书服务给我们带来的便利。而现在进入研究生生涯，科研成为学习

8、生活中很重要的一部分，对科研人员来说，文献检索是必须要学会的一门学问。没有学习这门课程之前，我以为我的检索文献的过程是合格的，而经过这阶段课程的学习，我才意识到自己的检索过程是很不合格的，甚至存在很多的错误，所以这门课程，我觉得是很有意义的，对我的作用很大，会对我的之后的科研工作很有帮助，可以说是收益匪浅，会让我少走很多弯路。现在我对于各个数据库的使用有了更深的了解。以前就只会用知网，万方来查文献，而且多采用的是最简单的傻瓜式的检索，虽然查到的文献量很大，可是要逐一进行筛查，剔除没有用的才能获得有用的文献，比较麻烦。而现在通过学习了这门课程后，我一般都会用高级检索，比较方便快捷省时。而且学会了

9、使用很快捷方便的图书馆新推出的外文发现系统，中文发现系统。在进行检索的时候，还学会了正确运用布尔逻辑等，使我的检索过程更加精确简练。之前不明白文献检索的奥妙所在，而我现在意识到文献检索这门课程要学好也不是很容易，我们必须多练习、多搜索，经常去查询、去摸索，并且要仔细的静下心来学习，这样才能掌握正确的检索方法，才能够快速而准确的找到自己真正所需要的文献资料。意见和建议：（1） 我觉得信息检索这门课程的上课形式可以做一下调整。可以老师讲授一节课，然后带着我们上机实际操作一下上节课的内容，这样的话对老师讲的检索方法会掌握的更牢靠。像现在我对老师讲的那些数据库还是不很了解，包括一些专业术语和检索步骤都还是不熟练，也可能会出现遗忘，所以我觉得上机实操的话会对我们这个课程带来更大的益处。（2） 另外我觉得这门课程的时间相对较短，老师