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文档简介

实验  酵母 RNA 的提取及组份鉴定与核酸的定量测定 【课前预习】1. 为什么用稀碱溶液可以使酵母细胞裂解?2如何从酵母中提取到较纯的 RNA?3干扰 RNA 的提取的物质有哪些并设计排除这些干扰的实验。4干扰紫外线(UV)吸收法测定核酸浓度实验的物质有哪些?【目的要求】1. 了解并掌握稀碱法提取 RNA 的原理和方法。2. 了解核酸的组分并掌握其鉴定方法。3. 学习紫外线(UV)吸收法测定核酸浓度的原理。【基本原理】由于 RNA 的来源和种类很多,因而提取制备方法也很各异。一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法。其中苯酚法又是实验是最常用的。组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA 即溶于上层被酚饱和的水相中,DNA 和蛋白质则留在酚层中。向水层加入乙醇后,RNA 即以白色絮状沉淀析出,此法能较好的除去 DNA 和蛋白质。上述方法提取的 RNA 具有生物活性。工业上常用稀碱法和浓盐法提取 RNA,用这两种方法所提取的核酸均为变性的 RNA,主要用作制备核苷酸的原料,其工艺比较简单。浓盐法使用 10%左右氯化钠溶液,90提取 3-4h,迅速冷却,提取液经离心后, 上清液用乙醇沉淀 RNA。稀碱法使用稀碱使酵母细胞裂解,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀 RNA 或调 pH2.5 利用等电点沉淀。酵母含 RNA 达 2.67-10.0%,而 DNA 含量仅为 0.03-0.516%,为此,提取 RNA 多以酵母为原料。RNA 含有核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸各组分。加硫酸煮可使 RNA 水解,从水解液中可用定糖,定磷和加银沉淀等方法测出上述组份的存在。核酸及其衍生物,核苷酸、核苷、嘌呤和嘧啶有吸收 UV 的性质,其吸收高峰在 260nm 波长处。核酸的摩尔消光系数(或称吸收系数)用 来表示。 为每升溶液中含有 1 克原子核酸磷的光吸收值(即 A 值)(表)。测得未知浓度核酸溶液的 A260nm 值,即可以计算出其中 RNA 或 DNA 的含量。该法操作简便,迅速,并对被测样品无损,用量也少。核酸摩尔消光系数及相应光吸收值(P) A260nmpH7,260nm含磷量/(%)1g/mLRNA 7700-7800 9.5 0.022-0.024DNA-Na 盐 6600 9.2 0.02(小牛胸腺)蛋白质也能吸收紫外光。通常蛋白质的吸收高峰在 280nm 波长处,在 260nm 出的吸收值仅为核酸的 1/10 或更低,因此对于含有微量蛋白质的核酸样品,测定误差较小。RNA 的 260nm 与 280nm 吸收的比值在 2.0 以上;DNA 的 260nm 与 280nmx 吸收的比值则在 1.9 左右,当样品中蛋白质含量较高时,比值下降。若样品内混在有大量的蛋白质和核苷酸等吸收紫外光的物质,应设法先除去。【实验用品】1. 试剂1) 0.04M NaOH 溶液;2) 95%乙醇;1.5M 硫酸;3) 浓氨水;4) 0.1M 硝酸银;5) 酸性乙醇溶液:30mL 乙醇加 0.3mL HCl;6) 三氯化铁浓盐溶液:将 2mL 10三氯化铁(FeCl3 6H2O)溶液加入 400mL 浓 HCl;7) 苔黑酚(3,5-二羟基甲苯)乙醇溶液:称取 6g 苔黑酚溶于 95乙醇 100mL。8) 定磷试剂:(1) 17硫酸:将 17mL 浓硫酸(比重 1084)缓缓倾入 83mL 水中;(2)2.5鉬酸铵:2.5g 鉬酸铵溶于 100mL 水中;(3)10抗坏血酸溶液:10g 抗坏血酸溶于 100mL 水,棕色并保存溶液;临用时将三种溶液和水按下列比例混合: 17硫酸:2.5鉬酸铵:10抗坏血酸:水1:1:1:2(V/V)。9) 钼酸铵过氯酸沉淀剂:取 3.6mL 70%过氯酸和 0.25g 钼酸铵溶于 96.4mL 蒸馏水中,即成 0.25%钼酸铵2.5%过氯酸溶液。10) 5-6%氨水:用 25-30%氨水稀释 5 倍。11) 钼酸铵过氯酸沉淀剂:取 3.6mL 70%过氯酸和 0.25g 钼酸铵溶于 96.4mL 蒸馏水中,即成 0.25%钼酸铵2.5%过氯酸溶液。12) 5-6%氨水:用 25-30%氨水稀释 5 倍。2. 测试样品干酵母粉。3. 器材移液管 0.2mL(1) ,0.5mL(2),1mL(4) ,2mL(4);滴管;容量瓶 50mL(3);量筒 10 mL(1) ;离心机;分光光度计;冰浴;水浴锅。【方法步骤】1. 酵母 RNA 提取称 5g 干酵母粉悬浮于 30mL 0.04M NaOH 溶液中并在研钵中研磨均匀。悬浮液转入三角烧瓶,沸水浴加热 30min,冷却,转入离心管。3000 转/分,离心 15 分钟后,将上清慢慢倾入10mL 酸性乙醇,边加边搅动。加毕,静置,待 RNA 沉淀完全后,3000r/min 离心 3min。弃去上清液。用 95乙醇洗涤沉淀两次。再用乙醚洗涤沉淀一次后,用乙醚将沉淀转移至布氏漏斗抽滤,沉淀在空气中干燥。称量所得 RNA 粗品的重量,计算。2.  RNA 组份鉴定取 2g 提取的核酸,加入 1.5M 硫酸 10mL, 沸水浴加热 10 分钟制成水解液,然后进行组份鉴定。1) 嘌呤碱:取水解液 1mL 加入过量浓氨水。然后加入 1mL 0.1M 硝酸银溶液,观察有无嘌呤碱银化合物沉淀。2) 核糖:取水解液 1mL,三氯化铁浓盐酸溶液 2mL 和苔黑酚乙醇溶液 0.2mL。放沸水浴中10min。注意观察核糖是否变成绿色。3) 磷酸:取水解液 1mL,加定磷试剂 1mL。在水浴中加热观察溶液是否变成蓝色。3. 紫外吸收法测定核酸的含量1) 准确称取待测核酸样品 0.5g,加少量 0.01mol/L NaOH 调成糊状,再加适量水,用 5-6%氨水调至 pH7.0,定容至 50mL。2) 取两支离心管,甲管加入 2mL 样品溶液和 2mL 蒸馏水,乙管加入 2mL 样品溶液和 2mL 沉淀剂。混匀,在冰浴上放置 30min。3) 在 3000r/min 下离心 10min。从甲、乙两管中分别吸取 0.5mL 上清液,用蒸馏水定容至50mL。选择厚度为 1cm 的石英比色杯,在 260nm 波长处测定 A 值。【实验结果】1. 干酵母粉 RNA 粗品的含量:2. 记录 RNA 组份鉴定各管的现象;3. 计算干 RNA 粉中核酸的含量:式中, 为甲管稀释液在 260nm 波长处 A 值减去乙管稀释液在 260nm 波长处 A 值;L比色杯的厚度,1cm; N

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