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文档简介
结构化学选读,课程基本目的,生物大分子结构与生物分子识别的基本原理 研究生物大分子结构与识别的生物物理化学方法 生物大分子结构与生物分子识别研究进展,课程主要内容,1、蛋白质及核酸结构原理 2、蛋白质结构预测方法 3、蛋白质折叠研究 4、用于蛋白质、核酸构象研究的光谱学方法 (紫外、荧光、圆二色光谱等) 5、生物分子识别研究的物理化学方法 (等温滴定量热,超速离心等) 6、 生物大分子结构测定 7、蛋白质及药物分子设计,蛋白质结构分类: 球蛋白(水溶性蛋白) 膜蛋白 纤维蛋白,蛋白质功能分类,催化功能 运输功能 营养和贮存功能 收缩和运动功能 结构功能 防御功能 调控功能 其它,蛋白质折叠问题,蛋白质序列、结构、功能,序列,结构,功能,有关的蛋白质结构数据库,蛋白质晶体结构数据库 Brookhaven PDB (生物信息服务器) RCSB-PDB () 蛋白质结构分类库 SCOP CATH PDBSUM,一级结构 二级结构 三级结构 四级结构,蛋白质的一级结构,20种氨基酸残基由肽键相连成的序列 AGPFSCHEDSGPFCSFPGA?,蛋白质结构原理 1、20种标准氨基酸 疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met 带电:Arg Lys Asp Glu (His) 极性:Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp 特殊:Gly (Pro) 2、多肽链状结构 3、二硫键 CYS-S-H + H-S-CYS CYS-S-S-CYS,20种标准氨基酸 疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met 带电:Arg Lys Asp Glu (His) 极性:Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp 特殊:Gly (Pro),氨基酸的稳定性与后修饰,Cys, Met Asn Ser, Thr, Tyr Gly Pro,His0.360 Cys0.210 Ser0.130 Lys0.100 Thr0.100 Asn0.080 Arg0.055 Gln0.050 Glu0.050 Asp0.045 Ala0.025 Met0.025,Ile-0.005 Tyr-0.040 Val-0.060 Gly-0.070 Phe-0
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