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文档简介

,DNA复制 DNA replication,DNA复制的一般特点,原料:dNTP 原则:互补配对原则 半保留复制 半不连续复制 需要引物 新链的延伸方向只能是5 3,复制起始点,复制起始点 replication origin,ori DNA分子的复制是在特定位置开始的,这个位点称为复制起始点。 原核生物DNA只有一个复制起始点。 真核生物DNA有多个复制起始点。,复制子 replicon,一个复制起始点控制下复制的一段DNA 原核生物DNA只有一个复制子 真核生物每条染色体上有多个复制子,原核生物复制子, 真核生物多个复制子,原核生物DNA复制,DNA复制所需要的酶 引物酶 primerase DNA聚合酶 DNA polymerase DNA连接酶 DNA ligase 解旋酶 helicase 单链DNA 结合蛋白 SSB :结合在分开的单链上,从而保持其伸展状态 拓扑异构酶:防止复制叉前形成一种张力而导致超螺旋的产生,现在已有大量的证据表明,大肠杆菌和其他许多原核生物的环状复制是双向的。即的复制从复制起点开始,向二个方向同时进行,最后相遇,完成复制。但并不是所有的生物DNA的复制都是双向的,如噬菌体的的复制就是沿一个方向进行的。,大肠杆菌三种DNA聚合酶比较,DNA 聚合酶,分子量 每个细胞的分子统计数 5-3 聚合酶作用 3-5 核酸外切酶作用 5-3 核酸外切酶作用,DNA 聚合酶,109,000 400 + + +,120,000 100 + + -,400,000 10-20 + + -,比较项目,DNA 聚合酶,切除引物 修复,修复,复制,功能,三种DNA聚合酶在决定DNA合成方面有一些共同的特性: 三种酶都只有聚合酶的功能,而没有 聚合酶功能,说明DNA链的延伸只能从5向3端进行。 他们都没有直接起始合成DNA的能力,只能在引物存在下进行链的延伸,因此,DNA 的合成必须有引物引导才能进行。 三种酶都有核酸外切酶的功能,可对合成过程中发生的错误进行校正,而保证DNA复制的高度准确性。,复制叉 replication fork,半不连续复制 先导链 随后链 冈崎片断 引物 primer,DNA复制过程,DNA双螺旋的解除:DNA的解旋过程由DNA解旋酶催化解开后,单链DNA 结合蛋白(SSB )马上结合在分开的单链上,从而保持其伸展状态。随着解链的进行,在DNA 复制叉前就会形成一种张力而导致超螺旋的产生。现在发现这种张力主要是通过DNA拓扑异构酶的作用消除的。 起始:在一种特殊的RNA聚合酶-DNA引物酶的催化下,先合成一段长560个核苷酸的RNA引物,提供3端自由-OH。然后,在DNA聚合酶的作用下进行DNA的合成。,延伸:只有一条DNA链的合成是连续的,而另一条链的合成是不连续的。所以从整个DNA分子水平来看,DNA两条新链的合成方向是相反的,但是都是从5端向3方向延伸。现在一般把一直从5向3方向延伸的链称作前导链,它是连续合成的。而另一条先沿5 3方向合成一些片段,然后再由连接酶将其连起来成为长链,称为后随链,其合成是不连续的。这种不连续合成是由冈崎等人首先发现的,所以现在将后随链上合成的DNA不连续单链小片段称为冈崎片段。 终止:引物RNA被切除,并为新合成的DNA片段所代替。在大肠杆菌中,此过程是在DNA聚合酶的催化下完成的。因为DNA聚合酶有5 3聚合酶功能,以临近冈崎片段的3端自由-OH进行DNA的合成,从而将RNA引物替换为DNA链。最后由连接酶将冈崎片段连接起来,形成一条完整的新链,端粒DNA的复制,真核生物DNA是线性的 线性DNA末端不能复制 每复制一次DNA序列就要缩短一节!,端粒酶 telomerase,端粒酶是一种核糖核蛋白,含有一个RNA分子 这个RNA分子就是合成端粒序列的模板 在体细胞中,端粒酶是没有活性的,胚胎细胞和肿瘤细胞中有端粒酶活性,真核和原核DNA细胞复制比较,细胞周期的特定时期复制(原核生物在整个细胞生长过程中都可以进行DNA复制),在原核生物中有DNA聚合酶、DNA聚合酶、DNA聚合酶三种聚合酶,并由DNA聚合酶同时控制两条链的合成。而在真核生物中共有,和5种DNA聚合酶。DNA聚合酶和DNA聚合酶是DNA合成的主要酶,由DNA聚合酶控制不连续的后随链的合成,而DNA聚合酶则控制前导链的合成,所以其两条链的合成是在两种不同的DNA聚合酶的控制下完成。DNA聚合酶可能与DNA修复有关,而DNA聚合酶则是线粒体中发现的唯一一种DNA聚合酶。,RNA的复制,有些病毒不含DNA,以RNA为遗传物质 RNA在RNA聚合酶作用下先合成“”链 “”链从“”链模板上释放出来 “”链作为模板再合成“”链,RNA转录与加工,原核细胞的基因结构,非编码区,非编码区,编码区,编码区上游,编码区下游,与RNA聚酶 结合位点,启动子,终止子,启动子 promotor :DNA分子上RNA聚合酶最先结合部位 终止子 terminator:提供转录终止信号的DNA序列 不依赖因子的终止子;依赖因子的终止子,接,真核细胞的基因结构,编码区,非编码区,非编码区,与RNA聚酶 结合位点,内含子,外显子,能够编码蛋白质的序列叫做外显子,不能够编码蛋白质的序列叫做内含子,内含子能转录为信使RNA,启动子,终止子,编码区上游,编码区上游,内含子,外显子,转录的概念和DNA的有义链和反义链,转录是在 DNA的指导下的RNA聚合酶的催化下,按照碱基配对的原则,以四种核苷酸为原料合成一条与模板DNA互补的RNA 的过程。RNA的转录从DNA模板的特定位点开始,并在一定的位点终止。此转录区域为一个转录单位。,启动子(promoter),终止子(terminator),模板链(反意义链),编码链(有意义链),非信息区,DNA,5,5,3,3,大肠杆菌RNA聚合酶的结构示意图,核心酶(2),起始因子,和模板DNA结合 起始和催化聚合反应,含有核苷三磷酸的结合位点 与RNA聚合酶的四聚体核心(2)的形成有关 只与RNA转录的起始有关,全酶( ),转录泡,RNA的合成过程,链的开始: RNA链转录的起始首先是RNA聚合酶在因子的作用下与DNA上的启动子部位结合,并在RNA聚合酶的催化下使DNA的双链解离,形成转录泡,为RNA合成提供单链模板,并按碱基配对原则,结合核苷酸,在核苷酸之间形成磷酸二脂键,使其相连,形成RNA新链。因子在RNA链伸长到89个核苷酸后,就被释放,然后由核心酶催化RNA的延伸。 链的延伸 RNA链的延伸是在因子释放之后,在RNA聚合酶四聚体核心酶的催化下进行。因RNA聚合酶同时具有解开DNA双链,并使其重新闭合的功能。随着RNA的延伸,RNA聚合酶使DNA双链不断解开和重新闭合。 链的终止 当RNA链延伸遇到终止信号(ternination signal)时,RNA转录复合体就发生解体,而使新合成的RNA链释放出来。,RNA合成过程,起始,双链DNA局部解开,磷酸二酯键形成,终止阶段,解链区到达基因终点,延长阶段,RNA,启动子(promoter),终止子(terminator),RNA合成的一般特点,不需要引物 原料为rNTP,不是dNTP 只有一条DNA链用作模板,真核生物和原核生物转录的差别,真核生物RNA的转录是在细胞核内进行, 而蛋白质的合成则是在细胞质内,所以,RNA转录后首先必须从核内运输到细胞质内,才能指导蛋白质的合成。在原核生物中,RNA的转录、蛋白质的合成以及mRNA的降解通常是同时进行的 真核生物一个mRNA分子一般只含有一个基因, 原核生物的一个mRNA分子通常含有多个基因。 真核生物有几种RNA聚合酶 :在原核生物中只有一种RNA聚合酶,催化所有RNA的合成,而在真核生物中则有RNA聚合酶、RNA聚合酶和RNA聚合酶三种不同的RNA聚合酶,分别催化不同类型RNA的合成。 真核生物RNA聚合酶不能独立转录RNA :原核生物中RNA聚合酶可以直接起始转录合成RNA ,真核生物则不然。在真核生物中,三种RNA聚合酶都必须在蛋白质转录因子的协助下才能进行RNA的转录。 5.真核生物启动子结构复杂,mRNA转录后的加工,加帽 当mRNA合成到30b时 在5端加7甲基鸟嘌呤核苷 加尾 转录完成后,在特定位置切去一节,加polyA RNA末端腺苷酸转移酶 帽子和尾巴对mRNA的稳定性以及运输具有重要作用 剪接 splicing,成熟mRNA与模板DNA的比较,mRNA,原核生物和真核生物mRNA的比较,遗传密码和蛋白质的翻译,遗传密码的性质,1、密码是无标点符号的且相邻密码子互不重叠。 2、密码的简并性:由一种以上密码子编码同一个 氨基酸的现象称为简并性,对应于同一氨基酸的密码子称为同义密码子。密码的简并性可以减少有害突变 。除两个氨基酸以外的所有氨基酸都有一种以上的密码子编码。 3、密码的摆动性(变偶性):密码的专一性主要是由第一第二个碱基所决定,tRNA上的反密码子与mRNA密码子配对时,密码子的第一、二位碱基是严格的,第三位碱基可以有一定的变动。 4、密码的通用性 5、 64组密码子中,AUG既是的密码,又是起始密 码;有三组密码不编码任何氨基酸,而是多肽链合成的终止密码子:UAG、UAA、UGA。,密码子与反密码子的配对关系,反密码子,tRNA,5,3,A U C,5,mRNA,3,密码子,1 2 3,氨基酸的活化,E,氨基酸,ATP +,氨酰腺苷酸,E-AMP,PPi,第一步,AMP,第二步,E,氨基酸的活化,3-氨酰-tRNA,氨酰- tRNA合成酶特点,a、专一性: 对氨基酸有极高的专一性,每种氨基酸都有专一的酶,只作用于L-氨基酸,不作用于D-氨基酸。 对tRNA 具有极高专一性。,b、校对作用:氨酰- tRNA合成酶的水解 部位可以水解错误活化的氨基酸。,原核生物多肽链的合成过程,原核生物多肽链的合成分为三个阶段:肽链合成的起始、肽链的延伸、肽链合成的终止和释放。,1、肽链合成的起始,2、肽链的延长,3、肽链合成的终止及释放,肽链合成的起始,30S亚基 mRNA IF3- IF1复合物,30S mRNA GTP- fMet tRNA- IF2- IF1复合物,70S起始复合物,mRNA +30S亚基-IF3,IF-1,70S起始复合物,肽链的延

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